Abstract
A fim de promover a identificação sistemática de novos genes com importantes papéis funcionais em câncer pancreático, temos desenvolvido uma estratégia de triagem multi-estágio para proporcionar uma base racional para a seleção do candidato novela altamente relevante genes com base nos resultados de análises de alto conteúdo funcionais. O fluxo de trabalho composto por três etapas consecutivas: 1) a expressão do gene de série de perfis análises de tecidos pancreáticos humanos primários, bem como uma série de
in vivo
e
in vitro
modelos de tumor características relevantes, a fim para identificar genes com padrões de expressão visíveis; 2) uso da tecnologia ‘reverso matriz transfecção “para grande escala em paralelo análises funcionais de genes candidatos potenciais em ensaios baseados em células; e 3) a seleção de genes candidatos individuais para análise mais aprofundada das suas funções celulares. Um total de 14 genes, entre eles 8 de famílias de genes “druggable”, foram classificados como candidatos de alta prioridade para a caracterização funcional individual. Como exemplo para demonstrar a validade da abordagem, os dados funcionais abrangentes sobre gene candidato ADRBK1 /GRK2, que nunca tiver sido implicado no cancro pancreático, é apresentada
Citation:. Buchholz M, Honstein T, Kirchhoff S , Kreider R, Schmidt H, Sipos B, et al. (2015) A multistep alta-Content Screening abordagem para identificar novos genes alvo funcionalmente relevantes em cancro do pâncreas. PLoS ONE 10 (4): e0122946. doi: 10.1371 /journal.pone.0122946
Editor do Academic: Chunhong Yan, Georgia Regents University, United States