PLOS ONE: método para avaliar múltiplos mediadores: Mediar Efeitos do Fumo e DPOC sobre a Associação entre o risco CHRNA5-A3 Variant e Lung Cancer

Abstract

Um modelo de mediação explora os efeitos diretos e indiretos entre uma variável independente e uma variável dependente, incluindo outras variáveis ​​(ou mediadores). análise de mediação foi recentemente usada para dissecar os efeitos directos e indirectos de variantes genéticas de doenças complexas usando estudos de caso-controle. No entanto, o viés pode surgir nas estimativas da associação variante genética mediador porque a presença ou ausência do mediador nas amostras do estudo não é amostrado seguindo os princípios do desenho do estudo de caso-controle. Neste caso, a análise de mediação usando dados de estudos caso-controle pode levar a estimativas tendenciosas de coeficientes e os efeitos indirectos. Neste artigo, nós investigamos um modelo de múltiplos mediação envolvendo um efeito mediador de três caminho através de dois mediadores, utilizando dados do estudo de caso-controle. Propomos uma abordagem para corrigir distorções na coeficientes e fornecer estimativas precisas quanto aos efeitos indiretos específicos. A nossa abordagem também pode ser utilizada quando o estudo de caso-controlo original for frequência correspondente em um dos mediadores. Nós empregamos bootstrapping para avaliar a importância dos efeitos indiretos. Realizamos estudos de simulação para investigar o desempenho da abordagem proposta, e mostrou que ele fornece estimativas mais precisas dos efeitos indiretos, bem como a percentagem mediada do que regressões padrão. Em seguida, aplicou esta abordagem para estudar os efeitos de mediação de ambos tabagismo e doença pulmonar obstrutiva crónica (DPOC) sobre a associação entre o locus do gene e câncer de pulmão risco CHRNA5-A3 utilizando dados de um estudo de caso-controle de câncer de pulmão. Os resultados mostraram que a variante genética influencia o risco de cancro do pulmão indirectamente através de todas as três vias diferentes. A percentagem de associação genética mediada foi de 18,3% através de fumar sozinho, 30,2% através de DPOC sozinho, e 20,6% através do caminho incluindo tanto tabagismo e DPOC, ea associação genética total de câncer variante-lung explicada pelos dois mediadores era 69,1%.

Citation: Wang J, Spitz MR, Amos CI, Wu X, Wetter DW, Cinciripini PM, et al. (2012) Método de Avaliação Múltiplos Mediadores: mediando Efeitos do Fumo e DPOC sobre a associação entre o CHRNA5-A3 Variant e Lung Cancer Risk. PLoS ONE 7 (10): e47705. doi: 10.1371 /journal.pone.0047705

editor: Juan P. de Torres, Clinica Universidad de Navarra, Espanha

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