Tal como acontece com qualquer outra forma de tratamento, mesoterapia pode ter efeitos secundários. Algumas ligeiras e transitórias Efeitos secundários que podem ocorrer após uma sessão de mesoterapia incluem inchaço, hematomas e dor ou comichão no local da injecção. Estes geralmente desaparecem em algumas horas a alguns dias. Um composto que faz com que tais inchaço quando injetado é a lecitina de composto. Alguns mesotherapists recomendar o arnica medicamento homeopático para reduzir o inchaço. No entanto, a sua acção não foi comprovada cientificamente. Mais frequentemente, os pacientes são aconselhados a usar roupas largas, e para evitar o exercício por até dois ou três dias após um tratamento Mesoterapia.

Outros efeitos secundários no local da injeção pode incluir cicatrizes, pigmentação, ou formação de úlcera. Às vezes, os pacientes podem sentir um pequeno nódulo sob o local da injecção, o que reduz ou desaparece depois de algumas semanas. Quando são utilizadas técnicas de injecção não estéreis, as infecções podem ocorrer, alguns dos quais podem ser potencialmente graves. A maioria dessas infecções foram relatadas de alguns países da América do Sul, onde os indivíduos não licenciados administrar tratamentos Mesoterapia. Portanto, é preferível receber Mesoterapia de um médico credenciado que pratica bom controle de infecção.

pacientes Mesoterapia podem ter reações alérgicas locais ou sistémicas para qualquer um dos compostos que são injetados. Estes podem variar de leve a potencialmente fatal. clínicos treinados saber reconhecer tais reações, e pode prontamente administrar o tratamento adequado. Esta é outra razão é aconselhável para ir para clínicas Mesoterapia respeitáveis. Existem relatórios ocasionais de doenças da pele não usuais, incluindo a psoríase, na literatura científica. Algumas delas são atribuídas à mistura de compostos que podem interagir uns com os outros.

Não está claro o que exatamente acontece com a gordura que é dissolvido em tratamentos Mesoterapia para celulite e gordura localizada remoção . Embora os defensores Mesoterapia reivindicar essa gordura é discriminado e excretada, tais alegações permanecem sem comprovação científica.