Abstract

Fundo

Há uma crescente demanda por biomarcadores precisos para a detecção do câncer colorretal não-invasiva precoce. Nós empregamos um método marcador descoberta escala genoma para identificar e verificar biomarcadores DNA candidato metilação para a detecção baseada em sangue de câncer colorretal.

Metodologia /Principais Achados

Foram utilizados dados de metilação de DNA de 711 colorectal tumores, 53 amostras emparelhadas adjacentes normal do cólon de tecidos, 286 amostras de sangue saudáveis ​​e 4.201 amostras de tumores de 15 tipos diferentes de câncer. dados de metilação de ADN foram gerados pela Illumina Infinium HumanMethylation27 e as plataformas HumanMethylation450, que determinam o estado de metilação de 27,578 e 482,421, respectivamente, locais de CpG. Nós realizada pela primeira vez uma seleção marcador de várias etapas para identificar marcadores candidatos com alta metilação em todos os tumores colorretais, enquanto abrigando baixo metilação em amostras saudáveis ​​e outros tipos de câncer. Em seguida, utilizou amostras pré-terapêutica de plasma e de soro de 107 pacientes com câncer colorretal e 98 controles sem câncer colorretal, confirmados por colonoscopia, para verificar marcadores candidatos. Foram selecionados dois marcadores para posterior avaliação: metilado

THBD

(THBD-M) e metilado

C9orf50

(C9orf50-M). Quando testado em amostras de plasma e soro clínicos destes marcadores superou antígeno medição soro carcinoembrionário (CEA) e resultou em um desempenho do teste sensível e específico alta para a detecção do câncer colorretal precoce.

Conclusões /Significado

A nossa descoberta marcador sistemática e estudo de verificação para os marcadores de metilação do DNA à base de sangue resultou em dois novos biomarcadores de câncer colorretal, THBD-M e C9orf50-M. THBD-M, em particular, mostrou promissor desempenho em amostras clínicas, justificando sua maior optimização e testes clínicos

Citation:. Lange CPE, Campan M, Hinoue T, Schmitz RF, van der Meulen-de Jong AE, Slingerland H , et ai. (2012) Genome-Scale descoberta do DNA-metilação Biomarcadores para a detecção de câncer colorretal Blood-Based. PLoS ONE 7 (11): e50266. doi: 10.1371 /journal.pone.0050266

editor: Carmen J. Marsit, Dartmouth Medical School, Estados Unidos da América

Recebido: 08 de agosto de 2012; Aceito: 17 de outubro de 2012; Publicado: November 28, 2012