PLOS ONE: Associação entre MMP1 -1607 1G & gt; 2G Polimorfismo e Head and Neck Cancer Risk: A Meta-Analysis

Abstract

Fundo

MMP1 é um membro importante da família endopeptidase MMP que desempenha um papel crítico no desenvolvimento de câncer de cabeça e pescoço (CCP). Diversos estudos têm investigado a associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de HNC, mas os seus resultados têm sido inconsistentes. Aqui, foi realizada uma meta-análise para explorar ainda mais o papel da

MMP1

-1607 1G . Polimorfismo 2G no desenvolvimento HNC

Métodos

Foram identificados todos os estudos elegíveis nas bases de dados eletrônicas do PubMed, ISI web of Knowledge, MEDLINE, Embase, e Google Scholar (de janeiro de 2000 a junho de 2012). Uma meta-análise foi realizada para avaliar a associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de HNC calculando odds ratio (OR) e intervalo de confiança de 95% (CIs)

resultados de

Doze estudos foram incluídos nesta meta-análise. Na comparação geral, foram encontradas associações significativas usando os modelos recessivo e alélicas de contraste (OR, 1,38; 95% CI, 1,07-1,79 e OR, 1,27; 95% CI, 1,05-1,53, respectivamente), mas nenhuma associação foi detectada usando o modelo dominante. Na análise estratificada por diversas variáveis, associações significativas foram observadas utilizando os modelos recessivos, dominantes e alélicas de contraste na população asiática (OR, 1,64; IC 95%, 1,29-2,08; OR, 1,39; IC 95%, 1,06-1,82 e OR, 1,41; 95% CI, 1,21-1,65, respectivamente), a população europeia (OR, 0,58; IC 95%, 0,40-0,84; OR, 0,64; IC 95%, 0,44-0,92; e OR, 0,68; 95 CI%, 0,54-0,85, respectivamente) e subgrupo de base populacional (OR, 1,24; IC 95%, 1,05-1,47; OR, 1,48; IC 95%, 1,04-2,12; e OR, 1,22; IC 95%, 1,07 -1,38, respectivamente). Além disso, as associações significativas foram detectadas no câncer de cavidade oral e câncer de nasofaringe sob o modelo recessivo

Conclusão

Os nossos resultados sugerem que o

MMP1

-1607 1G . Polimorfismo 2G é associado ao risco de HNC e que desempenha papéis diferentes em populações asiáticas e europeias. São necessários mais estudos com grande tamanho da amostra para validar nossas descobertas

Citation:. Zhang C, Song X, Zhu M, Shi S, Li M, Jin L, et al. (2013) Associação entre

MMP1

-1607 1G 2G Polimorfismo e Head and Neck Cancer Risk: A Meta-Analysis. PLoS ONE 8 (2): e56294. doi: 10.1371 /journal.pone.0056294

Autor: James P. Brody, da Universidade da Califórnia, em Irvine, Estados Unidos da América

Recebido: 30 de outubro de 2012; Aceito: 07 de janeiro de 2013; Publicação: 18 de fevereiro de 2013

Direitos de autor: © 2013 Zhang et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho foi parcialmente apoiado por subsídios da National Science Foundation Natural da China (No. 81070775, 81170899). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

Head and neck cancer (HNC) compreende globalmente tumores da cavidade oral, nasofaringe, orofaringe, hipofaringe e laringe, e é o sexto tipo de câncer mais comum no mundo [1]. Ela está associada com uma moderada alta taxa de recorrência, uma baixa taxa de sobrevivência, uma elevada frequência de segunda neoplasia primária (SPM), e uma alta prevalência de comorbidades [2]. Esta doença é altamente agressivo e pode causar morbidade significativa [3]. Embora o uso de tabaco, consumo de álcool, e infecções virais desempenham um papel importante na etiologia de HNC [4] – [6], apenas uma fracção desses sujeitos desenvolverem HNC, indicando que a susceptibilidade genética pode também contribuir para o seu desenvolvimento [7].

Matrix metaloproteinase-1 (MMP1) pode servir como um marcador molecular importante para HNC. MMP é uma família de endopeptidases dependentes de zinco, que são capazes de degradar essencialmente todos os componentes da matriz extracelular (ECM), como membranas basais, colagénio, fibronectina e [8] – [10]. A família MMP humanos, que consiste em, pelo menos, 26 proteases, pode ser dividido em vários subgrupos de acordo com a sua estrutura e especificidade de substrato [11], [12]. Estas subfamílias incluem colagenases, gelatinases, estromelisinas, matrilisinas, e MMPs do tipo membrana (MT-MMPs), entre outros. As MMPs têm um papel importante, tanto em condições fisiológicas e patológicas, incluindo a regeneração de tecido, reparação de feridas, reprodução, artrite, aterosclerose, doenças auto-imunes e desordens da pele [13] a formação de bolhas. As MMPs também têm sido implicados na carcinogénese por causa da sua capacidade para degradar a ECM, que é um evento chave na progressão do cancro [14]. Evidências crescentes têm mostrado que as MMPs pode facilitar o crescimento do tumor, invasão e metástase em vários cancros [14].

MMP1 (colagenase-1), localizado no cromossoma 11q22, é um membro importante da família MMP que especificamente degrada-se um dos principais componentes da ECM, colagénio do tipo I, bem como outros colagénios fibrilares de tipos II, III, V, IX e [15] – [16]. O

MMP1

gene é expresso em vários tipos de células normais, muitas vezes em níveis baixos em condições fisiológicas. No entanto,

expressão MMP1

gene aumenta dramaticamente em um grande número de doenças malignas, incluindo HNC [17].

A região promotora de

MMP1

desempenha um papel crítico na regulação

MMP1

transcrição do gene. Dentro desta região, um polimorfismo de nucleotídeo único funcional (SNP),

MMP1

-1607 1G 2G (rs1799750), foi identificado [18]. Tem sido relatado que

MMP1 1G

-1607 2G contém uma inserção guanina /polimorfismo de deleção na posição -1607, o qual é relativo ao local de iniciação da transcrição, e pode resultar em maior expressão de

MMP1

[19]. Vários estudos epidemiológicos moleculares examinaram a associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de HNC [20] – [30]; no entanto, os resultados têm sido inconsistentes. Para explorar ainda mais o papel da

MMP1

-1607 1G polimorfismo 2G em risco de HNC, foi realizada uma meta-análise de recolha e análise de dados de genotipagem de todos os estudos de caso-controle elegíveis publicados até à data

Materiais e Métodos

Pesquisa Estratégia

Para identificar todos os estudos de caso-controle elegíveis que examinaram a associação entre o

MMP1

polimorfismo eo risco de HNC (entre janeiro 2000 e Junho de 2012), foram realizadas buscas de palavras-chave nas bases de dados eletrônicas do PubMed, ISI web of Knowledge, MEDLINE, Embase, e Google Scholar. As palavras-chave que usamos incluídos “O câncer de cabeça e pescoço”, “câncer bucal”, “câncer da faringe”, “hipofaringe”, ou “o câncer de laringe”, e “MMP1”, “Matrix Metalloproteinase1”, “colagenase”, e ” polimorfismo “,” variante “,” genótipo “, ou” SNP “. Também foi realizada uma busca manual das referências dos artigos identificados a fim de encontrar estudos adicionais. Se os dados importantes não foram relatados nos artigos originais, que entraria em contato com os autores diretamente. Os resumos, relatórios inéditos e artigos escritos em idiomas diferentes do inglês foram excluídos.

Data Extraction

Todos extração de dados foi realizada por dois investigadores independentes, e eles chegaram a um consenso em todos os itens de discussão. As informações a seguir foi extraído de cada estudo incluído: primeiro autor, ano de publicação, a etnia da população do estudo (asiático ou europeu), o número de casos e controles, distribuição genotípica, métodos de genotipagem, alelo, etc.

Inclusão e critérios de exclusão

estudos elegíveis preencheram os seguintes critérios: (1) estudos sobre a associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de câncer de cabeça e pescoço, (2) caso- estudos de controle, (3) estudos com dados disponíveis suficientes para calcular uma razão de chances (OR) com intervalo de confiança de 95% (CI) e P -valor, e (4) estudos publicados em Inglês. Estudos com informação insuficiente sobre a freqüência do genótipo ou número não foram incluídos. Se a mesma população foi incluído, com sobreposição de dados, em mais de um estudo, somente o estudo mais recente ou completo foi incluído na meta-análise.

Análise Estatística

Primeiro, testamos Hardy-Weinberg (HWE) comparando as freqüências genotípicas esperadas e observadas do grupo de controle usando o teste do qui-quadrado de Pearson para a qualidade do ajuste. A associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de HNC foi avaliada por OR e IC 95%. Heterogeneidade entre os estudos foi avaliada pelo teste estatística χ2 baseada Q de Cochran. Se o -valor P para heterogeneidade foi 0,05, sugerindo que houve heterogeneidade óbvia dos dados, foi utilizado um modelo de efeitos aleatórios; caso contrário, foi utilizado um modelo de efeitos fixos para reunir os resultados. O teste I

2 também foi utilizado para estimar o grau de heterogeneidade entre os estudos. Como um guia, eu

2 valores de 25% foram considerados “baixa”, o valor de ~ 50% foram considerados “moderados”, e os valores de 75% foram considerados “elevados” [31]. Nós exploramos a associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de HNC usando um modelo de genética recessiva (2G /2G contra 1G /1G + 1G /2G), um modelo genético dominante (2G /2G + 1G /2G contra 1G /1G), e um modelo de contraste alélicas (alelo 2G contra o alelo 1G). As análises de subgrupo Além de uma comparação global, também realizada com base na etnicidade da população do estudo, a fonte dos controlos, e o local do tumor. O significado de RUP reunida foi detectada pelo teste Z (P 0,05 foi considerado significativo). Nós investigamos viés de publicação usando o gráfico de funil e teste de Egger. Análises de sensibilidade foram também aplicado para avaliar a estabilidade dos resultados, repetindo o meta-análise, omitindo cada um estudo de cada vez. Todos os valores de P foram em frente e verso, e todas as análises estatísticas foram realizadas utilizando Stata 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX).

Resultados

Características de Estudos

usando a estratégia de busca descrita, encontramos 45 artigos relevantes. Trinta e quatro estudos foram excluídos por não cumprirem os critérios de inclusão /exclusão: 25 estudos não foram relevantes para HNC ou

MMP1

; 4 estudos não têm dados suficientes para uma análise mais aprofundada; 4 estudos eram artigos de revisão; e um estudo era um artigo de comentário. Em um estudo de caso-controle que investiga o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo em duas populações independentes [29], cada população foi considerado como um estudo separado. Assim, foram incluídos 12 estudos [20] – [30] nesta meta-análise da associação entre o

MMP1

-1607 1G 2G polimorfismo eo risco de HNC (Figura 1). Características dos estudos, incluindo o ano de publicação, etnia população, local do tumor, os dados de genótipos, e tamanho da amostra (caso /controlo) são resumidas na Tabela 1. O método de genotipagem mais utilizada nestes estudos foi de polimorfismo de comprimento de fragmento de Polymerase Chain Reaction-restrição (PCR-RFLP). Todos, exceto um estudo [25] indicou que a distribuição genotípica dos controles era consistente com HWE ao nível de significância estatística de 0,05.

Dados Quantitativos síntese

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