Abstract

A prevalência de mutações germinativas patológicas no câncer colorretal tem sido amplamente estudado, como mutações germinativas nos genes de reparo de DNA

hMLH1

e

hMSH2

conferem um alto risco de câncer colorretal. No entanto, porque o tamanho da amostra e a população de estudos anteriores são muito diferentes umas das outras, as conclusões ainda permanecem controversos. Neste trabalho, bancos de dados tais como PubMed foram aplicados para procurar documentos relacionados. Os dados foram importados para Comprehensive Meta-Analysis V2, que foi utilizado para estimar a prevalência ponderada de

hMLH1

e

hMSH2

mutações patológicas e comparar as diferenças de prevalência entre diferentes histórias de família, etnias e fatores relacionados. Este estudo recolhidos e utilizados dados de 102 papéis. No grupo positiva Amsterdam-critérios, a prevalência de mutações germinativas patológicas do

hMLH1

e

hMSH2

genes foi 28,55% (IC 95% 26,04% -31,19%) e 19,41% (95 CI% 15,88% -23,51%), respectivamente, ea prevalência de mutações germinativas no

hMLH1

/

hMSH2

foi 15,44% /10,02%, 20,43% /13,26% e 15,43% /11,70 % em populações multiétnicas e europeus /Australian Asiática, Americana, respectivamente. mutações de substituição representaram a maior proporção de mutações germinativas (

hMLH1

: 52,34%,

hMSH Página 2: 43,25%). A prevalência total de mutações de

hMLH1

e

hMSH2

em Amsterdam-critérios, Amsterdam-de critérios negativos e esporádicos cancro colorectal positivos foi de cerca de 45%, 25% e 15%, respectivamente, e há houve diferenças óbvias na prevalência de mutações germinativas entre diferentes etnias

Citation:. Li D, Hu F, Wang F, Cui B, Dong X, Zhang W, et al. (2013) Prevalência de Patológica da linhagem germinativa Mutações do

hMLH1 Comprar e

hMSH2

Genes do câncer colorretal. PLoS ONE 8 (3): e51240. doi: 10.1371 /journal.pone.0051240

editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Estados Unidos da América

Recebido: 27 de junho de 2011; Aceito: 05 de novembro de 2012; Publicação: 19 de março de 2013

Direitos de autor: © 2013 Li et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Este trabalho foi apoiada por doações do National Science Foundation Natural da China (Grant número 30.671.801), a Fundação Harbin para os estudiosos devolvido (Grant número 2005AFLXJ017) e os Serviços de Saúde da Província de Heilongjiang (Grant número 2005-103). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução

o câncer colorretal (CRC) é um importante problema de saúde pública mundial [1], e é a segunda principal causa de morte por câncer nos países desenvolvidos. Nos países em desenvolvimento, CRC representa o sexto ou sétimo principal causa de morte por câncer [2].

Estima-se que câncer colorretal hereditário sem polipose (HNPCC) é responsável por algo entre menos de 1% a 13% [3] [4], de câncer colorretal, o que torna a síndrome CRC herdada mais comum [5], [6]. HNPCC é caracterizado por um padrão de hereditariedade autossómico dominante de início de cancro colorectal início, que está associada com malignidades do cólon adicionais, tais como endométrio, cancros gastrointestinais e urológicos superiores [7]. Não há fenótipo característico associado com HNPCC, e o seu diagnóstico é dependente do reconhecimento de uma forte história familiar sugestiva de hereditariedade dominante [8].

HNPCC, também conhecida como síndrome de Lynch (LS), é causada pela uma mutação da linha germinativa na reparação de emparelhamentos incorrectos do ADN (MMR) genes [9], [10]. Um sistema de funcionamento MMR normal pode reconhecer e corrigir as incompatibilidades de pares de base e pequenas nucleotídeo (1-4 pares de bases) mutações de inserção /deleção, que é essencial para a manutenção da estabilidade genômica [11].

Existem pelo menos de cinco mutações germinativas nos genes de reparo de DNA que pode causar síndrome de Lynch, incluindo

hMLH1

,

hMSH2

,

hMSH6

,

hPMS1

e

hPMS2

[12] – [17]. Mutações no

hMLH1

e

hMSH2

representam a maioria dos casos de síndrome de Lynch [18].

O

hMSH2

gene, que é um componente da via de reparação do ADN incompatibilidade, foi o primeiro gene identificado para ser associado com HNPCC. Ele serve como o “batedor” que reconhece e se liga directamente com a sequência de DNA com desemparelhamentos [19], [20] e pode formar um heterodímero com

hMSH6

quando um único par de bases ou incompatibilidade é reconhecido com

hMSH3

se existirem dois a oito inserções ou deleções de nucleótidos [11].

o

hMLH1

proteína do gene do produto é também uma componente da via de reparação de emparelhamentos incorrectos do ADN, que tem sido mostrado para formar um heterodímero com o

hMLH3

,

hPMS2 Comprar e

hPMS1

genes. No entanto, esta proteína tem atividade enzimática desconhecida e provavelmente age como um “casamenteiro molecular” que recruta outras proteínas de reparo do DNA para o complexo de reparo incompatível [21]

.

Uma vez que o

hMLH1 Comprar e

hMSH2

genes foram encontrados em seres humanos, a prevalência de mutações da linha germinativa tenha sido amplamente estudado, não só em caso de cancro colorrectal com uma história familiar sugestiva mas também em cancro colorectal esporádica. No entanto, os resultados destes estudos são inconsistentes, porque os tamanhos das amostras eram pequenas, e as origens étnicas foram variadas [22] – [24]. Portanto, uma revisão sistemática e meta-análise é essencial para fornecer recomendações para testes genéticos baseados no histórico familiar e uma base para a prevenção, diagnóstico precoce e tratamento do cancro colorectal.

Métodos

1 . critérios de estratégia de pesquisa e seleção

Bases de dados, incluindo a PubMed, Embase e Cochrane Library, foram aplicados de pesquisa para trabalhos relacionados publicados de janeiro de 1993 a março de 2011, com as seguintes palavras-chave:

hMLH1

,

hMSH2

, mutação, sem polipose câncer colorretal hereditário, câncer colorretal e /ou carcinoma, tumor ou neoplasia. papéis escolhidos foram limitadas àquelas que foram publicados em Inglês e atendido às seguintes critérios de selecção: 1) de papel avaliam somente um tipo específico de mutação ou de apenas regiões específicas de genes foram excluídos; 2) as mutações tinham de ser mutações germinativas com características patológicas mas não somática, foram excluídos os estudos que revelaram alteração somática da presença genes MMR; 3) relatos de casos foram excluídos; 4) relatórios repetitivos foram unificados, utilizando a mais recente ou a maior edição; 5) pesquisa sobre o polimorfismo foi excluído; 6) pacientes com síndrome de Lynch com mutações conhecidas de genes MMR foram excluídos; 7) o paciente detecção foi limitado a um diagnóstico de cancro colorectal em vez de outra síndrome de Lynch relacionadas com o cancro, como o cancro endometrial. O processo de selecção específico estudo foi mostrado na Figura S4 na informação de apoio.

2. Classificação da história familiar e etnia

Nós categorizados pacientes com câncer colorretal que preencheram os critérios rigorosos de Amsterdão (I ou II) [25] como o grupo AMSTERDAM-critérios positivo (AC +). Pacientes sem qualquer história familiar de câncer, independentemente da idade de início, foram classificados no grupo de câncer esporádico. Outros que tinham uma história familiar, mas não estritamente em conformidade com os critérios de Amesterdão foram definidos como o grupo negativo Amsterdam-critérios (AC). Além disso, chamamos os pacientes com história familiar ambíguo ou aqueles que não têm informação suficiente para ser re-classificada novamente, como a história da família não é clara grupo.

Uma vez que as informações sobre a etnia dos pacientes não foi bem -definida, tivemos que definir a etnia baseado em continentes, incluindo etnias multiétnicas, Europeia /australiana ou mistos Asiática, americana (alguns estudos não oferecem este tipo de dados ou dados incluídos americano, europeu e australiano).

3. estado MSI e categoria

Se mais do que 30% dos marcadores microssatélites tipicamente utilizados mostrar instabilidade, o tumor será considerado MSI-alta. MSI-estável (MSS) é definida como não há marcadores que indicam instabilidade [26], [27]. Caso contrário, o tumor é definida como a MSI-baixo. Para pacientes sem informações sobre o estado de microssatélites, nós classificá-los como MSI-não identificada. Além disso, definimos estudos que associaram a tumores MSI-alta e MSI-baixos como MSI.

4. Determinação da patogenicidade

Foi determinada a patogenicidade de mutações principalmente por três métodos combinados. Primeiro, nós adiada para as interpretações dos papéis originais e a definição patogênico incluindo: uma mutação frameshift que seria previsto para resultar em uma proteína truncada; mutações nonsense; Mutações apurados com um ensaio funcional; grandes deleções genómicas que removeram, pelo menos, um exão; ou duplicação de exão, a segregação da alteração com câncer na parentela [28]. Em segundo lugar, foi utilizado o programa PolyPhen analítica para prever essa mutação ser patogênica [29], Se a pontuação PolyPhen 2,0, em seguida, a mudança foi previsto para afetar a função da proteína. Última, nós verificamos dois sites, incluindo “International Society for Gastrointestinal hereditária Tumores Incorporated (insight) (www.insight-group.org/mutations/)” e “MMR Gene Não classificados Variantes Banco de Dados (www.mmruv.info)” para continuar a determinar a patogenicidade . Para aplicar ensaios funcionais será mais preciso e objetivo ao testar variantes missense de patogenicidade. Mas muitos artigos não poderia fazer isso devido a várias limitações; alguns estudos distinguem entre alterações patológicas com polimorfismo ou patogenicidade determinado quando as mesmas variantes fundadores na população de controlo. No banco de dados Insight, seu “patogenicidade Relatados” foi categorizada como relatado patogênico ou provavelmente patogênica e “Concluído patogenicidade” era desconhecida. Em seguida, considerou-a como patogenicidade relatados de acordo com estes resultados. Em nossa Meta-análise, categorizamos essas mutações patogênicas relatados ou reunião provavelmente patogênico da definição de mutações patogênicas.

5. Extração de dados

Dois investigadores (Dandan Li e Fulan Hu) extraíram independentemente os dados e verificadas todas as diferenças nas variáveis ​​até que um acordo foi alcançado em todos os itens. Informações como o primeiro autor, anos publicadas, continente, país, história familiar, locais de mutação, os tipos de mutação, e fenótipo MSI e métodos de detecção foi coletado de cada artigo.

6. A análise estatística

Os dados foram importados para Comprehensive Meta-Analysis V2, que estimou a prevalência ponderada e comparou a diferença de prevalência entre os fatores relacionados. Um nível de significância de 0,05 α foi aplicado. Para vários testes, um nível α de 0,05 foi ajustado a ct dividido pelo número de vários testes. Heterogeneidade entre os estudos foi avaliada com meta-regressão e eu

2 estatísticas. I

2 estatísticas incluídas 25, 50 e 75 correspondendo a baixa, média e alta heterogeneidade, respectivamente [30]. Se I

2 foi ≤50 combinado com as características dos dados [31], foi utilizado o modelo de efeitos fixos. Caso contrário, foram adotados modelos de efeitos aleatórios. O viés de publicação foi avaliada visualmente usando um gráfico de funil. O método de correlação sugerida por Begg [32] e a abordagem de regressão linear proposto por Egger et al. [33], [34] foram utilizados para analisar quantitativamente o potencial viés de publicação.

Resultados

Depois de filtrar para citação potencialmente relevantes, havia 796 resumos recuperados. Em seguida, excluídos os estudos que não tinham dados de detecção de mutações no gene claras. Finalmente, um total de 279 artigos sobre

hMLH1

e

hMSH2

mutações germinativas em câncer colorretal foram pesquisados ​​em um banco de dados eletrônico. No entanto, houve apenas 102 artigos incluídos neste estudo [6], [8], [24], [26], [35] – [132] com base nos critérios de selecção. Uma história familiar clara foi fornecida em 82 destes papéis. A população detectado veio de populações asiáticas, americanas, européias /Australian e mistos étnicos em 22, 11, 63 e 6 papéis, respectivamente. características básicas dos artigos incluídos são apresentados na Tabela S1 no apoio informações.

1. A prevalência de mutações patológicas germinativas em diferentes histórias de família

No total, 861 de 7057 e 698 de 7096 casos de cancro colorectal relataram tinha

hMLH1 Comprar e

hMSH2

mutações genéticas, respectivamente . Além disso, 1526 de 6965 casos tinham uma mutação em um gene ou outro quando ambos os genes foram selecionados

A maior prevalência de mutações germinativas patológicos ocorridos no AC grupo + e foi 28,55% (IC 95% 26,04%. – 31,19%) e 19,41% (IC 95% 15,88% -23,51%) nos

hMLH1

e

hMSH2

genes (

P

= 0.00 0,05), respectivamente . A prevalência no grupo AC- foi 16,70% (IC 95% 14,53% -19,13%) e 11,30% (IC 95% 9,49% -13,42%) (

P

= 0.00 0,05), respectivamente. No grupo de câncer esporádico, a prevalência de mutações foi 8,72% (IC 95% 6,12% -12,29%) e 7,28% (IC 95% 5,12% -10,26%) (

P

= 0,47 0,05) (Tabela 1). Grande heterogeneidade entre os todos os estudos incluídos foi observada em ambos

hMLH1

(I

2 = 80,10%) e

hMSH2

(I

2 = 79,98%) em todos os cânceres colorretais . No entanto, a heterogeneidade era a um nível aceitável para ambos os genes nos três subgrupos com história familiar claras (Tabela 1).

A prevalência total de mutações patológicas os dois genes “nos papéis que detectaram ambos eles foram 44,70% (IC 95% 39,13% -50,40%), 24,65% (IC 95% 20,37% -29,50%), 11,56% (IC 95% 7,11% -18,23%) e 17,02% (IC 95% 11,24% – 24,93%) nas AC +, CA, grupos não claras de câncer e de história da família esporádicos, respectivamente (

P

= 0.00 . 0,05) (Tabela 2)

2. A prevalência de mutações germinativas patológicas em diferentes etnias

No gene

hMLH1

, a prevalência de mutações germinativas patológicas no AC + grupo variou de 25,64% a 32,94% nos quatro etnias avaliados (

P

= 0,48 0,05). No grupo de CA, que variou de 14,88% a 17,35% (

P

= 0,99 0,05), e que variou de 3,21% a 16,71% (

P

= 0,13 0,05) no grupo de câncer esporádico (Tabela 1).

hMSH2

gene, a prevalência de mutação variou de 17,56% a 33,78% no AC + grupo, de 10,33% para 20,60% no grupo AC- e de 3,64% para 21,90% no grupo de câncer esporádico (AC +:

P

= 0.00 0,05; AC-:

P

= 0,91 0,05; esporádica :

P

= 0.00 0,05) nos quatro etnias avaliadas. No AC + e grupo do cancro esporádico, foram observadas diferenças no grupo etnias mistas em comparação com o grupo europeu /australiano (

P

= 0,000 0,007) e no grupo asiática em comparação com o grupo etnias misto (

P

= 0,000. 0,007), respectivamente (Tabela 1)

Refere-se aos artigos que tinham tanto gene que foram detectados, no AC + grupo, a prevalência total de mutação do

hMLH1

e

hMSH2 Compra de etnias multiétnicas, europeus /Australian e mistos asiáticos, norte-americano foi 38,01%, 54,02%, 42,59% e 66,09%, respectivamente (Tabela 2). No grupo AC-, a prevalência foi de cerca de 25% (

P

= 0,83 0,05). Em casos esporádicos, não havia uma vasta gama e a diferença na prevalência (a partir de 5,31% para 37,63%,

P

= 0,00 0,05) (Tabela 2). Houve diferenças óbvias entre essas etnias no AC + e grupos de câncer esporádicos (todos tinham

P

= 0,000 0,007). Outras análises mostraram que essas diferenças foram observadas em comparação com Asian etnias mistas e Australian Europeia /em comparação com etnias mistas. Não foram observadas diferenças entre as três etnias claras.

3. A distribuição mutação em diferentes exões

Todos os exões nestes dois genes mostrou mutações. A maior prevalência de mutação de 3,62% foi encontrado no exão 16 do

hMLH1

gene, com 2,19 mutações /100 pb, que, curiosamente, foi responsável por 16,36% de todas as mutações. Em adição ao exão 16, a prevalência da mutação foi maior no exão 2, exão 6, exão 8, exão 12, exão 13 e o exão 19. Mutações nestes sete exões (incluindo exon16) representou 55,45% do total de mutações. Na

hMSH2

gene, a prevalência da mutação e densidades em diferentes exons eram geralmente mais baixos do que os do gene

hMLH1

. A maior prevalência da mutação foi de 2,62% no exão 7. Aqueles no exão 3, exão 5, exão 11 e exon 12 também foram mais altas do que em outros exons. O total de mutações nestes cinco exons foram responsáveis ​​por 53,39% do total de mutações (Tabela 3).

4. Os tipos de mutações

Como se mostra na Tabela 4, foram realizadas três principais tipos de mutações de genes, incluindo substituições (com inclusão de transição e transversão), deleções ou inserções e grandes rearranjos genómicos. Substituição representaram 60,97% e 53,77% de todas as três mutações pontuais no

hMLH1

e

hMSH2

gene, respectivamente. O próximo maior exclusão foi, o que representou 24,15% e 36,98% do total, respectivamente.

5. estatuto MSI ea prevalência de mutações germinativas

Em MSI-alta fenótipo, a prevalência mutação no

hMLH1

gene foi 29,84% (IC 95% 22,43% -38,48%), 22,03% (95 CI% 13,66% -33,53%) e 18,34% (IC 95% 9,39% -32,72%) em AC +, AC- e câncer esporádico, respectivamente. A prevalência de mutação mais elevado seguinte foi nos grupos MSI-baixa e MSS. Não houve diferenças estatísticas entre diferentes histórias de família em todas essas três categorias MSI fenótipo (

P

foi de 0,25, 0,41 e 0,93, respectivamente).

A prevalência mutação no

hMSH2

gene também foi o mais elevado em AC + (26,81% IC95% 19,02% -36,35%), seguido por AC- (24,84%, 95% CI 16,14% -36,21%) e câncer esporádico (7,46%, 95% CI 2,64% -19,34%) com MSI-alta fenótipo, com diferenças estatísticas marginais (

P

= 0,04 0,05). Casos com MSS manifestado a menor prevalência de mutações nos diferentes grupos história familiar (

P

= 0,48 0,05). A prevalência na MSI de baixa foi moderada (

P

= 0,98 0,05). (Tabela 5)

Em artigos que detectaram ambos os genes, a prevalência da mutação foi o mais alto no AC + (53,41%, 95% CI 38,02% -68,17%), seguido por AC- (38,80%, 95% CI 27,87% -50,98%) e câncer esporádico (22,54%, 95% CI 12,55% -37,11%), com MSI de alta fenótipo (

P

= 0,02 0,05). Estes foram seguidos por casos com MSI-baixa e MSS nos diferentes grupos história familiar (

P Art 0,05).

6. Prevalência de mutações germinativas no assunto diferente definição de seleção

Houve 28 artigos da série de base populacional e 29 artigos da série baseada em clínicas que foram avaliados neste estudo. No gene

hMLH1

, a prevalência de mutação foi de 12,49 (IC 95% 8,65-17,71) no grupo de base populacional e 17,39 (IC 95% 13,62-21,93) no grupo-base clínica (

P

= 0,13). Na

hMSH2

gene, a prevalência de mutação foram 10,50% (IC 95% 6,94% -15,59%) e 12,03% (IC 95% 8,47% -16,80%), respectivamente (

P

= 0,62) (Tabela S5 em informações de apoio). Considerar, ainda, a diferença em cada grupo história familiar, não havia estatísticas significativas em nenhum grupo.

7. Prevalência de

hMLH1

e

hMSH2

área intron gene mutação germinativa

Os resultados revelaram que o maior frequência de mutação intrônica no grupo AC + foi 8,49% (IC 95% 6,43% -11,13%) e 5,42% (IC 95% 3,82% -7,64%) no

hMLH1 Comprar e

hMSH2

genes, respectivamente. A prevalência no grupo CA foi de 4,15% (IC 95% 2,75% -6,23%) e 4,01% (IC 95% 2,57% -6,21%), respectivamente. No câncer esporádico, a prevalência de mutações foi 5,81% (IC 95% 3,04% -10,84%) e 5,51% (IC 95% 2,76% -10,68%), respectivamente (Tabela S6 no apoio informações). E não houve diferenças entre diferentes etnias em qualquer gene (

hMLH1

:

P

= 0,78 em AC +,

P

= 0,12 em AC-,

P

= 0,38 no câncer esporádico;

hMSH2

:

P

= 0,44 em AC +,

P

= 0,41 em AC-,

P = 0,58

no câncer esporádico) (Tabela S6 em informações de apoio).

8. viés de publicação

parcelas do funil de a prevalência da mutação patológica nestes dois genes tanto em geral e com diferentes histórias familiares apresentaram algum grau de assimetria, com pequenos estudos sobre o lado esquerdo do terreno (figura S1, S2 e S3 em informações de apoio). Os resultados detalhados de uma regressão Egger, uma correlação Begg e uma análise de “Trim e Fill” para diferentes histórias de família com estes dois genes, tanto separadamente e em conjunto, são apresentados na Tabela 6.

Discussão

com base em uma revisão sistemática e meta-análise, verificou-se que a prevalência de mutação total de

hMLH1

e

hMSH2

em pacientes com ambos os genes selecionados foi 44,70%, 24,65% e 11,56% no AC +, AC- e grupos de câncer esporádicos, respectivamente. No entanto, as mutações relatadas nestes dois genes eram muito diferentes na síndrome de Lynch [6], [48], [59]. Uma das razões para a diferença foi que limita a região de mutação para exons eo tipo de mutação de patogenicidade, o que nos permitiu fornecer resultados de prevalência de mutação mais estáveis ​​através da execução de uma revisão sistemática e meta-análise.

Apesar de artigos sobre mutações em diferentes etnias têm sido publicados, há relatos têm descrito explicitamente quaisquer diferenças entre eles. Nossa análise descobriu que não houve diferença estatística significativa entre estes quatro etnias com diferentes histórias de família em toda a ambos os genes, separadamente ou em conjunto.

Apesar de banco de dados de introspecção ter recolhido informações sobre novas mutações em diferentes exons, poucos jornais ou sites forneceu informações sobre a prevalência específicas de exão e tipos de mutação detalhadas. Nossos resultados mostraram que uma notável alta prevalência da mutação ocorreu no exão 16. Foi também digno de nota que as mutações no exon 16 e exão 2 foram agregados principalmente a c.1852_1854delAAG e c.199G A, que respondeu por 37,78% e 29,03% das mutações, respectivamente (dados não mostrados). Em

hMSH2

, a prevalência mais elevada de mutação foi encontrada em exão 7. As mutações no exão 3 totais, exão 5, exão 7, o exão e o exão 11 12 elevou-se a 53,39% do total (Quadro 3). Portanto, quando se realiza

hMLH1

e

hMSH2

testes de mutação de genes, seria importante chamar a atenção para esses exons e seus pontos de mutação comuns.

Em Wei W. et ai. [133], três mutações (exon 8 c.649C

T, exão 14 c.1625A

T e exão 15 c.1721T

C) em

hMLH1 Comprar e quatro mutações (exão 1 c.23C

T e c.187dupG, exão 3 c.505A

G e exão 7 c.1168C

T) em

hMSH Página 2 tiveram uma prevalência muito maior em populações asiáticas do que em populações europeias. Além disso, três mutações (exão 13 c.1453G

C, exon 16 c.1742C

T e c.1758dupC) em

hMLH1

e dois ( exão 7 c.1255C

a e exão 12 c.1886A

G) no

hMSH2

só foram encontrados na população asiática, o que implica que específica mutações nesta população deve ser destacado na triagem de mutações nesses dois genes.

Nossos resultados mostraram que o principal tipo de mutação dos dois genes foi substituição e eliminação. A substituição de um nucleótido poderia resultar em missense, absurdo e mutações silenciosas, enquanto deleção e inserção tipicamente levam a grelha de leitura. Não houve diferenças no tipo de mutação por etnia em

hMSH2

(supressão

P

= 0,18 0,05; inserção

P

= 0,11 0,05; substituição de

P

= 0,85 0,05), mas havia no gene

hMLH1

. Para inserção, existiam diferenças entre as populações asiáticas e européias /Australian (

P

= 0.00 0,05). mutações de inserção foram responsáveis ​​por uma proporção maior na população asiática do que na população Europeia /Australiana (Tabela 4 e Tabela S4 no apoio informações).

Estes resultados sugerem que não só mutações pontuais ocorreu frequentemente em câncer colorretal, mas também grandes rearranjos genómicos estavam presentes em alguma extensão. Inicialmente, os métodos de detecção de grandes rearranjos genômicos foram a análise principalmente sul [115] e análise de conversão [18]. Recentemente, uma análise mais sensível MLPA foi realizada para os pacientes que não tinham mutações pontuais para determinar a ocorrência de grandes deleções genómicas destes dois genes [134]. Nos nossos estudos 102, há apenas cinco papéis usando MPLA, separadamente ou em combinação com outros métodos, o que representa 4,90% dos estudos totais. A prevalência de grandes rearranjos genômicos em

hMLH1

e

hMSH2

foi de 6,76% (IC 95% 3,11% -14,05%) e 13,56 (IC 95% 11,19% -16,32%) (dados não mostrado), respectivamente, que foi mais elevada do que os resultados na Tabela 4, onde os sujeitos e os métodos de detecção não foram especificados. Portanto, a prevalência mutação em resultados futuros é esperado para ser maior com o uso de métodos mais sensíveis para identificar grandes deleções genômicas.

Estudos têm revelado que os casos com instabilidade de microssatélites negativo pode também carregam mutações germinativas. A prevalência de mutação é amplamente variou em diferentes situações de MSI e com histórias de família diferentes [70]. A prevalência de mutação foi de 53,41% em AC + ‘pacientes com tumores que exibem MSI-fenótipo alta, o que sugeriu que o valor previsto de MSI-alto por mutações nestes dois genes foi 53,41% no grupo de AC +. O próximo mais alto foi 38,80% no grupo CA e, em seguida, 22,54% no grupo esporádico. Se tomamos MSI como um grupo (combinado MSI-alta, MSI-baixa e MSI (não pode identificar MSI-alta ou MSI-baixo)), o valor previsto correspondente foi de 57,12% (IC 95% 50,43% -63,55%) no grupo AC + (Tabela 5).

várias técnicas para a detecção de mutações são vulgarmente utilizados, incluindo imuno-histoquímica seguido de ADN-sequenciação, o polimorfismo conformacional de cadeia simples seguido por ADN-sequenciação, análise heteroduplex seguido de ADN-sequenciação, a desnaturação electroforese em gel de gradiente seguido de ADN-sequenciação, a desnaturação cromatografia líquida de alto desempenho, seguida por sequenciação de ADN e ADN-sequenciação directa. Análise do efeito de diferentes métodos de detecção sobre a prevalência descobriram que, em geral, não houve diferença significativa na prevalência detectados pelos quatro métodos em AC + (

P

= 0,60 0,05) e Ac- (

P

= 0,30 0,05) do grupo. No grupo esporádica, houve muito poucos estudos para análise (Tabela S2 no apoio informações).

A distinção entre uma série baseada em clínica de base populacional e foi feito, por isso foi um viés potencialmente importante do análise. No entanto, observou-se que não houve diferenças significativas na prevalência de mutação entre os grupos de base populacional, com base clínica e em qualquer gene. Ao considerar os efeitos de história familiar, a conclusão não se alterou (Tabela S5 no apoio informações).

Houve maior heterogeneidade na prevalência total. Resultados da regressão Meta mostrou que 22,34% dessa heterogeneidade foi explicada por diferentes histórias familiares (

P

= 0,00) (Tabela S3 em informações de apoio). análise de subgrupo mostraram que a heterogeneidade foi em níveis moderados ou baixos para diferentes histórias de família no que diz respeito à prevalência nestes dois genes. Além da história da família, fatores como anos desde a publicação, etnias e diferentes métodos de detecção também foram analisadas, e nenhum deles mostrou qualquer efeito estatisticamente significativo sobre a heterogeneidade (Tabela S3 no apoio informações).

A partir de parcelas de funil (Figura S2 e S3 em informações de apoio), observou-se que os dados da meta-análise para a prevalência de mutação com diferentes histórias de família dos dois genes estavam todos inclinado para a esquerda. Uma análise adicional por regressão quantidade Egger e métodos de correlação Begg sobre o grau de assimetria descobriram que a assimetria do lado esquerdo foi estatisticamente significativo, em algumas situações (Tabela 6). Isto indicou que um aumento do número de publicações aceites e tamanhos pequeno estudo não teve efeito sobre os resultados positivos. Isso só ilustrado que mais estudos com amostras pequenas e menor capacidade de detecção foram realizados e publicados. No entanto, ainda pode usar “Trim e Fill” para ajustar o valor dos dados originais [135]. Observou-se que o valor ajustado aumentou de 28,55% para 33,94% no

hMLH1

gene e de 19,41% para 23,00% no

hMSH2

gene no AC + grupo (Tabela 6).

Além de mutações nos exons, algumas das variantes patogênicas mais comuns são intrônica. Então, a gente procurou sistematicamente trabalhos sobre associações entre intervenientes da sequência ou da área intron mutações e síndrome de Lynch, e nós também analisou a diferença de prevalência entre os fatores relacionados, como história familiar e etnias (Tabela S6 em informações de apoio). Quando se calculou os dois genes combinados, a frequência de mutação intrónica era 12,30% (95% IC 9,80% -15,33%) no grupo AC + e 5,90% (IC 95% 4,08% -8,47%) no grupo AC. Além disso, verificou-se que as variantes deletérias patogénicos mais comuns na síndrome de Lynch foram

hMSH2

Intron5 c.942 + 3A T, e

hMLH1

Intron9 c.790 + 1G A, com um consequência mutacional de exclusão de exon5 em

hMSH2 Comprar e uma deleção de exon9-10 em

hMLH1

.

a análise de sensibilidade indicou que os resultados de nosso estudo foram confiável e estável. No entanto, esta meta-análise ainda tem algumas limitações, como as informações do histórico familiar dos pacientes não ser claramente explicadas e estudos que forneçam informações etnia insuficientes ter de ser grosseiramente classificadas. No grupo de câncer colorretal esporádico, a população de detecção foi geralmente filtrado pelo fenótipo MSI ou idade de início [64], [129]. Além disso, estudos suficientes sobre o câncer colorecal esporádica e informações sobre gênero precisam ser mais analisadas. Além disso, a fim de controlar os padrões de qualidade e uniformes para artigos, a língua escrita foi limitado para Inglês, o que pode ter afetado o número de estudos incluídos.

Não só

hMLH1

e

gene hMSH2

, que continua preocupado com a prevalência destas mutações de outros genes MMR, em particular

hMSH6

ou

hPMS2

. Em 2009, uma revisão sistemática foi realizada e uma meta-análise foi realizada para determinar a frequência de

hMSH6

mutação no colorectal e cancro do endométrio por nossa equipe acadêmica [136].