PLOS ONE: Análise da Human Proteome Prostático Específico Definido por transcriptómica e Antibody-Based Profiling Identifica TMEM79 e ACOXL como dois putativos, marcadores de diagnóstico no câncer de próstata

Abstract

Para melhor compreender a função de próstata e doença, é importante definir e explorar os componentes moleculares que significam a próstata. O objetivo deste estudo foi definir a próstata transcriptoma específico e proteoma, em comparação com 26 outros tecidos humanos. sequenciamento profundo do mRNA (RNA-seq) e perfis de proteína à base de imuno-histoquímica foram combinados para identificar padrões de expressão de genes específicos da próstata e para explorar biomarcadores de tecido para uso clínico potencial no diagnóstico de câncer de próstata. Foram identificados 203 genes com expressão elevada na próstata, dos quais 22 apresentaram mais de cinco dobra-os níveis de expressão mais elevados em comparação com todos os outros tipos de tecidos. Além de proteínas previamente conhecidas foram identificadas duas proteínas fracamente caracterizados, TMEM79 e ACOXL, com potencial para se diferenciar entre as glândulas prostáticas benignas e em biópsias de tecidos cancerosos. Em conclusão, temos aplicado uma análise de todo o genoma para identificar o proteoma específico da próstata utilizando transcriptomics e perfis de proteína à base de anticorpos para identificar genes com expressão elevada na próstata. Nossos dados fornece um ponto de partida para estudos funcionais adicionais para explorar o repertório molecular de próstata normais e doentes incluindo potenciais marcadores de câncer de próstata, como TMEM79 e ACOXL

Citation:. O’Hurley G, Busch C, Fagerberg L, Hallström BM, Stadler C, Tolf A, et al. (2015) Análise da Human Proteome Prostático Específico Definido por transcriptómica e Antibody-Based Profiling Identifica TMEM79 e ACOXL como dois putativos, marcadores de diagnóstico no câncer de próstata. PLoS ONE 10 (8): e0133449. doi: 10.1371 /journal.pone.0133449

Edição: Natasha Kyprianou, da Universidade de Kentucky College of Medicine, United States

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