PLOS ONE: Detecção de metilado CDO1 em Plasma de câncer colorretal; Um estudo de PCR

Abstract

Fundo

A cisteína biologia é importante para a quimio-sensibilidade das células cancerosas. Nossa pesquisa centrou-se sobre o silenciamento epigenético do tipo cisteína dioxigenase 1 (CDO1) em câncer colorretal (CRC). Neste estudo, descrevemos a detecção de

CDO1

metilação no plasma de pacientes com CCR usando metilação específicas de PCR (Q-MSP) e extensa análise da reação de PCR.

Métodos

o DNA foi extraído a partir de plasma e analisaram-se para a metilação do

CDO1

gene usando Q-MSP. A taxa de detecção de

foi calculada CDO1

metilação de genes e comparada com a do ADN extraído de células diluída DLD1 de “controlo positivo”.

foi então determinada CDO1

metilação do gene no plasma de 40 pacientes de CRC que foram clinicopathologically analisados.

Resultados

(1) A análise da sequência clonada detectado 93,3% de metilação do promotor ilhas CpG do

gene CDO1

de células DLD1 controlo positivo e 4,7% metilação do controlo negativo HepG2

CDO1

gene. (2) DLD1

ADN CDO1

não poderia ser detectado neste ensaio, se o DNA extraído foi diluída ~1000 dobra. Quanto mais o ADN que foi utilizado para a reacção de PCR, a mais eficaz foi amplificado em Q-MSP. (3) Ao aumentar a quantidade de ADN utilizada, metilado

CDO1

pode ser claramente detectado no plasma de 8 (20%) dos pacientes de CRC. No entanto, a percentagem de pacientes de CRC detectado por metilado

CDO1

no plasma foi menor do que a detectada pelo CEA (35,9%) ou CA19-9 (23,1%) no soro pré-operatório. Combinação de CEA /CA19-9 mais metilado no plasma

CDO1

poderia aumentar a taxa de detecção de pacientes de CRC curáveis ​​(39,3%) do que para CEA /CA19-9 (25%).

conclusão

Nós descrevemos detecção de

CDO1

metilação no plasma de pacientes com CCR. Embora

CDO1

metilação não foi detectada tão frequentemente como marcadores tumorais convencionais, análise de plasma

CDO1

metilação em combinação com níveis de CEA /CA19-9 aumenta a taxa de detecção de pacientes com CCR curáveis.

Citation: Yamashita K, Waraya M, Kim MS, Sidransky D, Katada N, Sato T, et al. (2014) Detecção de metilado

CDO1

em Plasma de câncer colorretal; Um estudo de PCR. PLoS ONE 9 (12): e113546. doi: 10.1371 /journal.pone.0113546

editor: Diego CALVISI, Universidade de Medicina, Greifswald, Alemanha

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