Abstract
Fundo
A cisteína biologia é importante para a quimio-sensibilidade das células cancerosas. Nossa pesquisa centrou-se sobre o silenciamento epigenético do tipo cisteína dioxigenase 1 (CDO1) em câncer colorretal (CRC). Neste estudo, descrevemos a detecção de
CDO1
metilação no plasma de pacientes com CCR usando metilação específicas de PCR (Q-MSP) e extensa análise da reação de PCR.
Métodos
o DNA foi extraído a partir de plasma e analisaram-se para a metilação do
CDO1
gene usando Q-MSP. A taxa de detecção de
foi calculada CDO1
metilação de genes e comparada com a do ADN extraído de células diluída DLD1 de “controlo positivo”.
foi então determinada CDO1
metilação do gene no plasma de 40 pacientes de CRC que foram clinicopathologically analisados.
Resultados
(1) A análise da sequência clonada detectado 93,3% de metilação do promotor ilhas CpG do
gene CDO1
de células DLD1 controlo positivo e 4,7% metilação do controlo negativo HepG2
CDO1
gene. (2) DLD1
ADN CDO1
não poderia ser detectado neste ensaio, se o DNA extraído foi diluída ~1000 dobra. Quanto mais o ADN que foi utilizado para a reacção de PCR, a mais eficaz foi amplificado em Q-MSP. (3) Ao aumentar a quantidade de ADN utilizada, metilado
CDO1
pode ser claramente detectado no plasma de 8 (20%) dos pacientes de CRC. No entanto, a percentagem de pacientes de CRC detectado por metilado
CDO1
no plasma foi menor do que a detectada pelo CEA (35,9%) ou CA19-9 (23,1%) no soro pré-operatório. Combinação de CEA /CA19-9 mais metilado no plasma
CDO1
poderia aumentar a taxa de detecção de pacientes de CRC curáveis (39,3%) do que para CEA /CA19-9 (25%).
conclusão
Nós descrevemos detecção de
CDO1
metilação no plasma de pacientes com CCR. Embora
CDO1
metilação não foi detectada tão frequentemente como marcadores tumorais convencionais, análise de plasma
CDO1
metilação em combinação com níveis de CEA /CA19-9 aumenta a taxa de detecção de pacientes com CCR curáveis.
Citation: Yamashita K, Waraya M, Kim MS, Sidransky D, Katada N, Sato T, et al. (2014) Detecção de metilado
CDO1
em Plasma de câncer colorretal; Um estudo de PCR. PLoS ONE 9 (12): e113546. doi: 10.1371 /journal.pone.0113546
editor: Diego CALVISI, Universidade de Medicina, Greifswald, Alemanha