Sumário

Biomarkers derivados de perfil de expressão gênica de dados pode ter uma alta taxa de falsos positivos e devem ser rigorosamente validados usando conjuntos de dados clínicos independentes, que nem sempre estão disponíveis. Embora sistemas de modelo animal pode fornecer conjuntos de dados alternativas para formular hipóteses e limitar o número de assinaturas para ser testado em amostras clínicas, o poder preditivo de uma tal abordagem ainda não foi comprovada. O presente estudo tem por objetivo analisar as assinaturas moleculares de câncer de fígado em um modelo de rato c-MET-transgênica e investigar sua relevância prognóstico para carcinoma hepatocelular humano (HCC). As amostras de tecido foram obtidas a partir de tumor (TU), adjacente não-tumoral (AN) e fígado distante normal (DN) em Tet-operador regulada (TRE) ratinhos transgénicos de c-met humana (n = 21), bem como a partir de uma coorte chinês de 272 HBV e 9 pacientes HCC associado com o HCV. Total perfil de expressão do genoma de microarray foi realizado em Affymetrix fichas de expressão de genes, e significados de prognóstico de assinaturas de expressão de genes foram avaliadas através das duas espécies. Nossos dados revelaram paralelos entre mouse e tumores de fígado humano, incluindo a infra-regulação de vias metabólicas e aumento da regulação dos processos do ciclo celular. Os tumores de ratos eram mais semelhante a um subconjunto de amostras de pacientes, caracterizado por a activação da via Wnt, mas distinta nos sinais via p53. Do potencial utilidade clínica, identificamos um conjunto de genes que foram regulados em ambos os tumores de ratos e HCC humana com poder preditivo significativo na sobrevida global e livre de doença, que foram altamente enriquecido para as funções metabólicas. Nas conclusões, este estudo fornece evidências de que um modelo de doença podem servir como uma possível plataforma para gerar hipóteses a serem testadas em tecidos humanos e destaca um método eficiente para gerar assinaturas de biomarcadores antes de ter sido iniciado extensos ensaios clínicos.

Citation : Ivanovska I, Zhang C, Liu AM, Wong KF, Lee NP, P Lewis, et ai. (2011) Assinaturas gene derivado de um cancro do fígado do rato Modelo c-MET-Driven prever a sobrevida de pacientes com carcinoma hepatocelular. PLoS ONE 6 (9): e24582. doi: 10.1371 /journal.pone.0024582

editor: Wanjin Hong, do Instituto de Biologia Molecular e Celular, Singapura

Recebido: 09 de maio de 2011; Aceito: 14 de agosto de 2011; Publicado: September 16, 2011