Abstract
Fundo
Nós previamente identificada uma associação entre um gene de reparo incompatível,
MLH1
, promotor SNP (rs1800734) e microssatélite instável (MSI-H) colorectal cancros (CRCs) em duas amostras. O presente estudo se expandiu nesta descoberta como nós explorada a base genética da metilação do DNA na região do cromossomo 3. A hipótese que polimorfismos específicos no
MLH1 região dos genes predispõem para a metilação do DNA, resultando na perda de
MLH1
expressão gênica, função incompatibilidade-reparação, e, consequentemente, do genoma-wide instabilidade de microssatélites.
Metodologia /Principais achados
em primeiro lugar temos testado nossa hipótese em uma amostra de Ontário (901 casos, 1.097 controles) e replicadas principais descobertas em duas amostras adicionais de Terra Nova e Labrador (479 casos, 336 controles) e de Seattle (591 casos, 629 controles). A regressão logística foi utilizado para testar a associação entre SNPs na região de
MLH1 Comprar e CRC, MSI-H CRC,
MLH1
expressão genética no CRC, e metilação do DNA no CRC. A associação entre rs1800734 e MSI-H CRCs, anteriormente relatados em Ontário e Newfoundland, foi replicado na amostra Seattle. Dois SNPs adicionais, em forte desequilíbrio de ligação com rs1800734, mostrou fortes associações com
MLH1
metilação do promotor, perda de proteínas MLH1, e MSI-H CRC em todas as três amostras. O modelo de regressão logística da MSI-H CRC, que incluiu
MLH1
estatuto -promoter-metilação e estado immunohisotchemistry MLH1 caber a maioria parcimoniosamente em todas as três amostras combinadas. Quando rs1800734 foi adicionada a este modelo, o seu efeito não foi estatisticamente significativa (
P
-valor = 0,72 vs. 2,3 × 10
-4 quando o SNP foi examinado isoladamente).
conclusões /Significado
a associação observada do rs1800734 com MSI-H CRC ocorre por meio de seu efeito sobre o
MLH1
metilação do promotor, a deficiência de MLH1 IHC, ou ambos
Citation.: Mrkonjic M, Roslin NM, Greenwood CM, Raptis S, Pollett A, Laird PW, et al. (2010) As variantes específicas no MLH1 Gene Região Maio movimentação DNA metilação, perda da expressão da proteína, e câncer colorretal MSI-H. PLoS ONE 5 (10): e13314. doi: 10.1371 /journal.pone.0013314
editor: Alfons Navarro, da Universidade de Barcelona, Espanha