Sumário
Os microRNAs (miRNAs) participar em diversos caminhos biológicos e pode atuar tanto como genes supressores tumorais ou oncogenes. polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em miRNA podem contribuir para o desenvolvimento do cancro com alterações nas propriedades e /ou de maturação do microRNA. Polimorfismos em miRNAs têm sido sugeridos na predisposição ao risco de câncer; No entanto, estudos têm mostrado acumulados conslusionss inconsistente. Para validar, ainda, determinar se existe qualquer associação potencial entre os quatro SNPs comuns (MIR-196a2C T, rs11614913; miR-146aG C, rs2910164; miR-499A G, rs3746444; miR-149c T, rs2292832) ea risco para o desenvolvimento de risco, uma meta-análise foi realizada de acordo com os 40 estudos de caso-controle publicados. odds ratio (OR) com intervalo de confiança de 95% (IC) foram calculados para avaliar a extensão da associação. Os resultados demonstraram que o genótipo rs11614913TT foi significativamente associada com um risco de câncer diminuíram, em particular, com uma diminuição do risco de cancro colo-rectal e cancro do pulmão, ou para o subgrupo população asiática. Além disso, o alelo rs2910164C foi associada a uma diminuição do risco de cancro do esófago, cancro do colo do útero, cancro da próstata, e o carcinoma hepatocelular (HCC), em particular no subgrupo população Asiática. Da mesma forma, o alelo rs3746444G foi observada como fator de risco para o câncer na população asiática. Conclui-se que dois SNPs prsent em miRNAs (rs11614913TT e rs2910164C) pode proteger contra a patogênese de alguns cancros, e que o rs3746444 pode aumentar o risco de câncer de
Citation:. Ele B, Pan Y, Cho WC , Xu Y, G Gu, Nie Z, et al. (2012) A associação entre quatro variantes genéticas em MicroRNAs (rs11614913, rs2910164, rs3746444, rs2292832) e Risco de Câncer: Evidências de estudos publicados. PLoS ONE 7 (11): e49032. doi: 10.1371 /journal.pone.0049032
editor: Georgina L. Segure, University of Aberdeen, Reino Unido
Recebido: 05 de agosto de 2012; Aceito: 03 de outubro de 2012; Publicação: 14 de novembro de 2012
Direitos de autor: © 2012 He et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados
Financiamento:. Este projecto foi apoiado por uma bolsa da National Natural Science Foundation da China (81200401), Programa de cultivo dos talentos saudáveis para Nanjing City, eo desenvolvimento social Projetos de Tecnologia de Nanjing City, China (QYK11175). Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito
CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes
Introdução
MicroRNAs (miARNs) são pequenos, de cadeia simples, 19-21 nucleótidos de comprimento moléculas de RNA, funcionando como reguladores negativos que envolvem a expressão do gene de pós-transcricional através da ligação a regiões seus mRNAs alvo e, consequentemente, não codificadora de proteínas conduzir a clivagem de ARNm ou de translação repressão [1]. evidências acumuladas mostrou que miARNs regular a expressão de aproximadamente 10-30% das todos os genes humanos através de mecanismos de pós-transcrição [2], contribuindo para fisiológica excessiva e condições patológicas, incluindo a diferenciação celular, proliferação e apoptose [1], e inparticular para o desenvolvimento e progressão de vários cancros humanos através da regulação da expressão de proto-oncogenes ou genes supressores de tumor [3], [4], [5].
SNPs em genes de miARN são considerados por afectarem a função três maneiras: em primeiro lugar, através da transcrição do transcrito primário; segundo, através de pri-miRNA e processamento pré-miRNA; e terceiro, através dos efeitos sobre interações miRNA-RNAm [6]. Recentemente, vários estudos têm demonstrado que alguns polimorfismos (SNPs) presentes nos genes de miARN, que podem alterar a expressão de miARN e /ou maturação e ser associada com o desenvolvimento e progressão do cancro [6]. Por exemplo, quatro SNPs – miR-196a2C T (ou rs11614913), miR-146aG C (rs2910164), miR-499A G (rs3746444), e miR-149c T (rs2292832) – identificados no pré-miARN regiões de miR-146a, de miR-149, miR-196a2, e miR-499, respectivamente, têm sido relatados para ser associada com o risco de cancro [7], [8]. No entanto, conclusões dos estudos relevantes permanecem inconsistentes, em parte devido à heterogeneidade do subtipo de câncer, pequeno tamanho da amostra, e etnia dos pacientes. Para continuar a determinar se existe uma associação entre os quatro SNPs nos genes miRNA com o risco de desenvolver câncer, uma revisão abrangente e análise de dados publicados a partir de diferentes estudos é necessária. Neste estudo, temos extensa revisão da literatura e realizaram uma meta-análise com base em todos os caso-controle elegíveis dados publicados para avaliar a associação entre os quatro polimorfismos e suscetibilidade ao câncer.
Materiais e Métodos
Identificação de estudos elegíveis
Foi realizado uma pesquisa das bases de dados PubMed e Embase para todos os relatórios relevantes usando as palavras-chave “microRNA /miR-146a /miR-149 /miR-196a2 /miR-499 ‘, “polimorfismo” e “câncer” (atualizado até 23 de junho de 2012). A pesquisa foi limitada a trabalhos de língua inglesa e estudos sujeitos humanos. Foram avaliadas publicações potencialmente relevantes, examinando seus títulos e resumos, posteriormente, todos os estudos correspondentes aos critérios de inclusão elegíveis foram recuperados. Além disso, estudos foram identificados por uma busca manual das referências listadas nos comentários envolvidas. Todos os estudos foram incluídos se cumpridos os seguintes critérios:. (I) sobre a rs11614913, rs2910164, rs3746444, e polimorfismos rs2292832 e câncer risco, (ii) a partir de um estudo desenhado de caso-controle, e (iii) freqüências genotípicas disponíveis
os dados de extração
Todos os dados que preencham os critérios de selecção foram extraídos independentemente por dois funcionários (BSH, e YQX). Para cada estudo, as seguintes características foram extraídos: o primeiro do último nome do autor, ano de publicação, país de origem, etnia, os números de casos genotipados e controles, fonte de grupos de controle (controles populacionais ou em hospitais), métodos de genotipagem e do tipo de câncer. descidas étnicos foram classificados como caucasianos, asiáticos ou mista (que incluiu mais de uma descendência étnica). Um estudo incluiu as informações para o genótipo rs11614913 CT + TT, sem os dados de CT e TT genótipos, por isso, só foram capazes de calcular o OR para a comparação entre CT + TT vs. TT [9].
a análise estatística
os quatro SNPs em miRNAs foram testados para as associações com suscetibilidade ao câncer com base em diferentes modelos genéticos. A meta-análise examinou a associação global dos quatro SNPs com o risco de câncer, medida pelo odds ratio (OR) nos intervalos de confiança de 95% (IC). Para contrastar o homozigoto do tipo selvagem (WW), estimou-se pela primeira vez o risco do homozigoto raro alelo (RR) e heterozigotos genótipos (WR) em cancros, então avaliado o risco de câncer sob um modelo dominante (RR + WR vs. WW ). Além disso, as associações modelo recessivo, também foram estimados (RR vs. WR + WW). Além disso, análises estratificadas também foram realizadas por etnia (asiática e caucasiano), tipo de câncer (se apenas um tipo de câncer continha menos de dois estudos individuais foi combinado em grupo dos Outros Cânceres “) e fonte de controlo para rs11614913 e rs2910164. análises estratificadas foram realizadas por etnia para rs2292382, e por etnia e tipo de câncer para rs3746444, respectivamente
A significância estatística do pool ou foi determinada com o teste Z, e um valor de P . 0,05 foi considerado significativo. A heterogeneidade entre os estudos foi avaliada pelo teste estatístico baseado Q Qui-quadrado [10], com a heterogeneidade (
P
h) 0,05 foi considerado como significativo. Um modelo de efeito fixo utilizando o método de Mantel-Haenszel e um modelo de efeitos aleatórios utilizando o método DerSimonian e Laird foram usadas para reunir os dados [11]. O modelo de efeitos aleatórios foi utilizado quando heterogeneidade nos resultados dos estudos foi encontrado; caso contrário, foi utilizado o modelo de efeito fixo. As análises de sensibilidade foram realizados para avaliar a estabilidade dos resultados, a saber, um estudo único na meta-análise foi eliminada de cada vez de modo a reflectir a influência de um dos dados individuais fixados na ou misturadas. Para determinar se houve um viés de publicação, funil de parcelas e os testes de regressão linear de Egger foram aplicadas [12].
Todos os testes estatísticos para esta meta-análise foram realizadas com STATA versão 10.0 (College Station Corporação Stata, TX, EUA).
resultados
Características dos estudos
Um total de 40 estudos elegíveis preencheram os critérios de inclusão pré-especificados (veja a figura S1), em que 27, 26, 13 e 6 estudos foram pooleded para as análises da rs11614913, rs2910164, rs37464444, e rs2292832, respectivamente (Tabela 1). Todos os estudos foram estudos de caso-controle, incluindo 8 estudos sobre o câncer hepatocelular (HCC), 5 do cancro da mama, 5 câncer gástrico, 4 de câncer colorretal, 3 cancro do pulmão, e 15 em outros tipos de câncer, e um no peito /câncer de ovário foi inscrito . Havia 28 estudos de descendente Asiático, 11 dos descendentes caucasianos e um de etnia mista [13]. Para determinar os SNPs, a genotipagem por polimorfismo em cadeia de polimerase de comprimento de fragmentos de restrição de reacção (PCR-RFLP) e ensaio TaqMan foram realizados estudos nos 28. Além disso, 34 estudos foram incluídos com base no sexo-controle e para os grupos de casos pareados por idade (seis estudos com 2.050 casos e 2.626 controles não foram pareados por idade ou sexo), dos quais 33 foram de base populacional e sete eram do hospital baseado.
síntese quantitativa
para o polimorfismo rs11614913, foram observadas diferenças significativas de comparação de TT vs. CC e TT vs. CC + CT. Quando agrupados pelos tipos de câncer, associações significativas foram ainda encontradas no cancro colorectal (TT vs. CC: OR = 0,70 IC 95%: 0,57-0,85,
P
h = 0,284; TT + TC vs. CC: OR IC = 0,77, 95%: 0,65-0,91,
P
h = 0,377; TT vs. CC + TC: OR = 0,80, 95% CI: 0,69-0,94,
P
h = 0,198), cancro do pulmão (TT vs. CC: OR IC = 0,77, 95%: 0,65-0,91,
P
h = 0,284; TT + TC vs. CC: OR = 0,85, 95% CI: 0,74-0,98,
P
h = 0,289; TT vs. CC + TC: OR IC = 0,83, 95%: 0,73-0,95,
P
h = 0,281). Além da diminuição do risco de cancro colo-rectal e cancro do pulmão, também foi observada uma diminuição do risco em outros grupos de câncer (CT vs. CC: OR = 1,23, 95% CI: 1,10-2,13,
P
h = 0,239; TT + CT vs. CC: OR = 1,13, 95% CI: 1,03-1,25,
P
h = 0,096). análise de subgrupo pela etnia revelou uma associação significativa na comparação do TT vs. CC (OR = 0,80 IC 95%: 0,73-0,88,
P
h = 0,169) e TT vs. CC + CT (OR = 0,85, 95% CI: 0,80-0,92,
P
h = 0,300) na população asiática. análise de subgrupo determinado pela fonte de controlo revelaram uma associação significativa entre o risco polimorfismo e câncer em ambos o hospital e controles de base populacional de comparação de TT vs. CC e TT vs. CT + CC; Além disso, uma diminuição do risco também foi observada para a comparação de TT + CT vs. CC no estudo de base hospitalar, como resumido na Tabela 2.
Para o polimorfismo rs2910164, não foi observada associação significativa do risco nos a análise global combinada. No entanto, a análise do câncer de tipo subgrupo revelou uma diminuição do risco de comparação de CC vs. GG no subgrupo de HCC (OR = 0,76 IC 95%: 0,59-0,99,
P
h = 0,313 ), o câncer de próstata (OR = 0,77, 95% CI: 0,65-0,91,
P
h = 0,425), o câncer cervical (OR = 0,50, 95% CI: 0,37-0,68,
P
h = 0,814) e do esôfago câncer (OR = 0,58, 95% CI: 0,37-0,90,
P
h = 0,055). Da mesma forma, foi observada uma diminuição do risco de comparação de GC vs. GG no câncer cervical (OR = 0,71 IC 95%: 0,51-0,99,
P
h = 0,254), CC + GC vs. GG em câncer de esôfago (OR = 0,79, 95% CI: 0,65-0,96,
P
h = 0,195), e CC vs. GG + GC no cancro da próstata (OR = 0,65, 95 CI%: 0,44-0,96,
P
h = 0,699) e do esôfago câncer (OR = 0,64, 95% CI: 0,41-0,98,
P
h = 0,079 ). análise de subgrupo por etnia revelou uma diminuição do risco na população asiática (CC vs. GG: OR = 0,80, 95% CI: 0,67-0,96,
P
h = 0,000; GC vs. GG: OR = 0,91, 95% CI: 0,84-0,98,
P
h = 0,139; CC + GC vs. GG: OR IC = 0,88, 95%: 0,79-0,99,
P
h = 0,002; CC vs. GG + GC: OR IC = 0,86, 95%: 0,76-0,98,
P
h = 0,000), mas não população caucasiana. Também foi observada uma diminuição do risco de comparação de CC vs. GG tanto em população com base estudos (OR = 0,87, 95% CI: 0,77-0,98,
P
h = 0,000) e os controles com suporte hospitalar (OR = 0,65, 95% CI: 0,53-0,79,
P
h = 0,000) quando realizada análise de subgrupo pela fonte de controles. Em contraste, foi também observado um aumento do risco no grupo de outros cancros para a comparação do CC + GC vs GG (OR IC = 1,09, 95%: 1,00-1,19, Z = 2,02,
P = 0,043
,
P
h = 0,222), conforme resumido na Tabela 3.
para o polimorfismo rs3746444, não houve associação significativa do risco observado para a análise global combinada do risco de câncer . No entanto, foram observados aumento dos riscos para a GG vs AA (OR = 1,23 IC 95%: 1,00-1,50, Z = 2.00,
P
= 0,045,
P
h = 0,118), GA vs AA (OR = 1,19 IC 95%: 1,01-1,41,
P
h = 0,001) e CC + GC vs. GG (OR = 1,14 IC 95%: 1,05-1,25,
P
h = 0,003) na população asiática, em vez de na população caucasiana resumidos na Tabela 4. Para o rs2292832, não houve associação significativa observada em todas as comparações (dados não mostrados ).
Teste de heterogeneidade
Houve heterogeneidade significativa entre os estudos da rs11614913, rs2910164, rs3746444, e, portanto, a fonte de heterogeneidade foi explorada pela comparação heterozigoto. Para a rs11614913, tipo de câncer (χ2 = 23,68, df = 5,
P
= 0,000) e fonte de controlo (χ2 = 5,63, df = 1,
P
= 0,018) foram os fonte de heterogeneidade. Para o polimorfismo rs2910164, tipo de câncer (χ2 = 27,65, df = 6,
P
= 0,000) e etnia (χ2 = 15,52, df = 3,
P
= 0,000) contribuiu substancialmente para a heterogeneidade. Para o polimorfismo rs3746444, etnia (χ2 = 8,38, df = 1,
P
= 0,004) contribuíram substancialmente para heterogeneidade.
A análise de sensibilidade revelou que os quatro estudos independentes [14], [15 ], [16], [17] foram a principal causa de heterogeneidade para a rs11614913. A heterogeneidade foi diminuída quando esses estudos foram removidos (TT + CT vs. CC:
P
h = 0,061,
I
2 = 33,49%). Da mesma forma, a heterogeneidade do rs2910164 (CC + GC vs. GG:
P
h = 0,060,
I
2 = 33,5%) e rs3746444 (GG + GA vs . AA:
P
h = 0,092,
I
2 = 39,8%) diminuíram quando os quatro [18], [19], [20], [ ,,,0],21] e os três [16], [22], [23] estudos independentes removido, respectivamente.
o viés de publicação
plot funil de Begg e teste de Egger foram realizados para avaliar o viés de publicação de a literatura actualmente disponíveis. A forma das parcelas funil não revelou qualquer evidência de assimetria evidente em todos os modelos de comparação. Em seguida, o teste de Egger foi usado para fornecer dados estatísticos para a simetria gráfico de funil. Os resultados também não mostraram qualquer evidência de viés de publicação (rs11614913:
t
= 0,25,
P
= 0,806, rs2910164:
t
= -0,70,
P
= 0,489, rs37464444:
t
= 1,88,
P
= 0,087, e rs2292832:
t
= 1,14,
P
= 0,318 para o modelo dominante. Figura 1).
Cada círculo indica um estudo independente para a associação indicada. Log [OR], logaritmo natural de OR. linha horizontal representa o tamanho médio do efeito. A: rs11614913, B: rs2910164, C: rs37464444, D: rs2292832
Discussão
Nesta meta-análise, uma associação entre as quatro SNPs comuns em microRNAs (rs11614913,. rs2910164, rs3746444 e rs2292832) eo risco de câncer foi avaliada pelos resultados obtidos a partir de 40 estudos publicados. Os resultados demonstraram que o genótipo rs11614913TT foi associada a uma diminuição do risco de desenvolver cancro, em especial para o cancro colorectal e o cancro do pulmão, ou na população Asiática, e que o alelo rs2910164C foi associada a uma diminuição do risco para o desenvolvimento de cancro do esófago, cancro do colo do útero , cancro da próstata e carcinoma hepatocelular, em particular na população asiática. Ao contrário do que precede, o alelo rs3746444G foi observada como fator de risco para o câncer na população asiática; No entanto, o polimorfismo rs2292832 não estava associada com o risco de cancro.
O polimorfismo rs11614913 presente no miR-196a2 tem significativamente maior impacto na expressão de miR-196a e está associada com os vários carcinogénese [24], [25], [26]. Embora houvesse estudos sem associação direta entre rs11614913 ea expressão de miR-196a [9], [13], estudos, meta-análises anteriores sugeriram uma associação entre rs11614913 e risco de câncer [7], [27], [ ,,,0],28], [29], esta meta-análise atualizada apoiar ainda mais a rs11614913 genótipo TT foi associada a uma diminuição do risco de câncer. Além disso, associações significativas foram observadas na população Asiática mas não na população caucasiana, sugerindo uma possível diferença étnica no fundo genético e o meio ambiente, o que foi o semelhante ao descrito por Chu et ai [28] e Wang et ai [ ,,,0],27]. Em contraste com os resultados agrupados publicados, esta atualizados resultados agrupados revelou que o TT rs116114913 poderia ser um fator protetor contra o câncer colo-rectal e cancro do pulmão. No entanto, nenhuma associação significativa foi observada no cancro da mama, sugerindo que mecanismos cancerígenas podem diferir nos locais de tumor e variantes genéticas hsa-miR-196a2 .. O risco de diferentes tipos de câncer devem ser confirmados por mais estudos
.
para o rs2910164, nenhuma associação significativa foi observada no resultado global combinada, tal como defendido pelo relatório por Xu et [7] al. Em contraste com os resultados publicados, este estudo revelou a diferentes associação entre o polimorfismo rs2910164 eo risco de câncer entre etnia e os tipos de câncer. O genótipo rs2910164 CC foi associado com diminuição do risco de câncer de esôfago, câncer de colo uterino, câncer de próstata, e HCC na população asiática, sugerindo uma diferença de fundo genético e do ambiente, e patogênese de diferentes locais do tumor. O rs2910164 no miR-146aG C do gene está localizado na região oposta à haste maduro sequência de miR-146 e resulta em uma mudança de G:U par de C:U incompatibilidade na estrutura de haste de precursor de miR-146a. Tem sido relatado que o precursor de miR-146a L-alélica pode aumentar a produção de madura miR-146a e de ligação de mRNA-alvo que afecta [18], [19].
O polimorfismo rs3746444 presente no miR-499 teria como alvo a SOX6 e genes Rod1 papéis importantes para a etiologia dos casos de câncer [30], [31]. Os resultados obtidos a partir de 13 estudos revelaram que o alelo rs3746444G foi associada com um risco aumentado para o desenvolvimento de cancro na população Asiática. Para nosso conhecimento, esta é a primeira meta-analysisabout a associação de rs3746444 de câncer de 11 estudos populacionais asiáticos e dois estudos de população caucasiana. Mais estudos devem ser acumulados para confirmar os resultados. O polimorfismo rs2292832 também foi avaliada por seis estudos inscritos, sem se encontraram associações significativas de todos os resultados combinados. Até o momento, poucos estudos epidemiológicos investigaram a associação do polimorfismo rs2292832 eo risco de câncer
.
Foram observadas A heterogeneidade entre os estudos para os polimorfismos de rs11614913, rs2910164, rs3746444, a fonte da heterogeneidade foram principalmente do câncer tipo, como glioma, vesícula biliar, bexiga e carcinoma papilífero de tireóide e câncer cervical, sugerindo polimorfismos em miRNAs podem desempenhar diferentes papéis de acordo com o tipo de câncer. Além disso, diferente risco de polimorfismos em miARNs foi também a fonte da heterogeneidade, associações significativas foram observadas nos estudos para a maioria das populações asiáticas. Os estudos com base em diferentes fontes de controle foram também a fonte da heterogeneidade dos estudos.
Apesar de meta-análise é robusta, o nosso estudo ainda tem algumas limitações. Em primeiro lugar, a nossa meta-análise não avaliou qualquer potencial de interação gene-gene e gene-ambiente interacção devido à falta de dados relevantes publicados. Em segundo lugar, apesar de todos os estudos elegíveis foram resumidos, o tamanho relativamente pequeno da amostra de estudos pode levar a poder estatístico reduzida quando estratificados de acordo com o status tipo de tumor, etnia ou infecção. Por último, relativamente grande heterogeneidade foi observada entre os todos os estudos envolvidos.
Em resumo, esta meta-análise sugeriu que o genótipo rs11614913TT foi associado com um risco de câncer diminuiu, especialmente para o cancro colo-rectal e cancro do pulmão, que o rs2910164C alelo foi um fator de proteção para câncer de esôfago, câncer de colo uterino, câncer de próstata e HCC, e que os rs11614913, rs2910164, e SNPs rs3746444 foram fatores de risco para o câncer na população asiática.
Informações de Suporte
Figura S1 .
Processo de seleção do estudo de estudos de caso-controle.
doi: 10.1371 /journal.pone.0049032.s001
(DOC)
Reconhecimentos
Agradecemos Prof. Hong-Guang Xie, Laboratório Central, Nanjing Primeiro Hospital, Nanjing Medical University, Jiangsu, China, por sua revisão crítica e edição científica do manuscrito e comentários construtivos.