PLOS ONE: Análise comparativa 3UTR permite a identificação de Clusters regulamentar que unidade Ef /ephrin Expressão em linhas celulares de cancro

Sumário

receptores Eph são a maior família de receptores tirosina-quinase. Juntamente com seus ligantes, os Efrinas, eles cumprem várias funções biológicas. expressão aberrante de EPHS /Efrinas levando a um aumento receptor Eph para ephrin rácios ligante é um fator crítico na tumorigênese, indicando que a regulação apertada de Ef e expressão ephrin é essencial para o comportamento celular normal. As regiões 3 ‘não traduzida (3’UTRs) de transcritos de desempenhar um papel importante ainda amplamente subestimada no controlo da expressão da proteína. Com base no pressuposto de que paralogues de famílias de genes grandes podem apresentar uma organização conservada de elementos reguladores nas suas 3’UTRs aplicou-se uma abordagem bioinformática /biologia molecular novo para as sequências 3’UTR de Eph transcritos /efrina. Foram identificados grupos de motivos constituídos por elementos de poliadenilação citoplasmática (CPEs), elementos ricos em AU (Ares) e sítios de ligação Hur. Estes aglomerados ligar vários factores de estabilização de ARN e desestabilizadores, incluindo Hur. Surpreendentemente, apesar do seu papel largamente aceite como uma proteína estabilizante de ARNm, que mostram ainda que a ligação de Hur a estes aglomerados realmente desestabiliza transcritos Ef /efrina em linhas celulares de tumor. Consequentemente, knockdown de Hur modula grandemente expressão de múltiplos EPHS /Efrinas em ambos os mRNA e os níveis de proteína. Juntos, nossos estudos sugerem que a superexpressão de Hur como encontrado em muitos tumores progressivos pode ser uma causa para o receptor desordenada Ef às relações ligando efrina levando a um maior grau de invasão do tecido

Citation:. Inverno J, Roepcke S, S Krause , Müller CE, Otto A, Vingron M, et al. (2008) Análise Comparativa 3’UTR permite a identificação de Clusters regulamentar que unidade Ef /ephrin Expressão em linhas celulares de cancro. PLoS ONE 3 (7): e2780. doi: 10.1371 /journal.pone.0002780

editor: Thomas Preiss, Chang Instituto de Pesquisa Cardíaca Victor, Austrália

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