Abstract
Fundo
Foi analisada a associação entre 53 genes relacionados ao reparo de DNA e danos resposta mediada por p53 eo risco de câncer de ovário seroso usando dados de caso-controle do cancro do ovário da Carolina do Norte estudo (NCOCS), um estudo caso-controle de base populacional.
Métodos /principais conclusões
a análise foi restrita a 364 casos de câncer invasivo seroso do ovário e 761 controles de branco, não raça hispânica. A análise estatística foi duas fases: uma tela usando fatores de Bayes marginais (BFS) para 484 SNPs e uma etapa de modelagem na qual calculamos multivariados ajustados probabilidades posteriores de associação para 77 SNPs que passavam na tela. Essas probabilidades eram condicionais da idade sujeita ao diagnóstico /entrevista, lote, a qualidade do DNA métrica e genótipos de outros SNPs e permitiu a incerteza nas parametrizações genéticas do SNPs e número de SNPs associado. Seis SNPs tinha Bayes fatores superior a 10 em favor de uma associação com o câncer de ovário seroso invasivo. Estes rs5762746 incluídos (mediana OR (odds ratio)
per alelo = 0,66; 95% intervalo de credibilidade (CI) = 0,44-1,00) e rs6005835 (
mediana
OR
per alelo
= 0,69; IC95% = 0,53-0,91
) em
CHEK2
, rs2078486 (mediana OR
per alelo = 1,65; IC95% = 1,21-2,25) e rs12951053 (mediana OR
por alelo = 1,65; IC95% = 1,20-2,26) em
TP53
, rs411697 (mediana OR
homozigoto rara = 0,53; IC95% = 0,35-0,79) em
Bach1
e rs10131 (
mediana ou
homozigoto rara =
não estimável) em
LIG4
. Os seis SNPs mais altamente associados são marcas previsto para ser funcionalmente significativo ou estão em LD com essa variante. As variantes em TP53 foram confirmados para ser associado em um grande estudo de acompanhamento.
Conclusões /Significado
Com base em nossos resultados, maior tempo de acompanhamento das vias de reparo de DNA e de resposta em um conjunto de dados maior é garantido para confirmar estes resultados
Citation:. Schildkraut JM, Iversen ES, Wilson MA, Clyde MA, Moorman PG, Palmieri RT, et al. (2010) Associação entre DNA danos resposta e genes de reparo e risco de câncer de ovário seroso invasiva. PLoS ONE 5 (4): e10061. doi: 10.1371 /journal.pone.0010061
editor: Marie-Pierre Dubé, Universite de Montreal, Canadá