PLOS ONE: Novel KRAS Gene mutações no câncer colorretal esporádico

Abstract

Introdução

Neste artigo, relatamos 7 novos KRAS mutações no gene descoberto enquanto retrospectivamente estudar a prevalência e padrão de mutações KRAS no tecido canceroso obtido a partir de 56 pacientes com câncer colorretal esporádico sauditas da Província Oriental.

Métodos

DNA genômico foi extraído de, tecidos colorretais cancerosos e não cancerosos embebidos em parafina fixadas em formalina. Os produtos de PCR bem sucedidos e específicos foram então bi-direcional sequenciado para detectar exão 4 mutações, enquanto Mutector II Detecção Kits foram utilizados para a identificação de mutações nos códons 12, 13 e 61. O impacto funcional das novas mutações foi avaliado usando ferramentas de bioinformática e modelagem molecular.

resultados

mutações no gene KRAS foram detectados no tecido de câncer de 24 casos (42,85%). Destas, 11 tinham mutações exão 4 (19,64%). Eles abrigaram 8 mutações diferentes todos os quais, exceto dois alterado a sequência de aminoácidos da proteína KRAS e todos, exceto um foram romance como revelado pela base de dados cósmica. As novas mutações detectadas foram encontrados para ser somática. Uma mutação é predito para ser benigno. As mutações restantes estão previstos para causar mudanças substanciais na estrutura da proteína. Destes, a mutação nonsense Q150X é a segunda mutação truncando a serem relatados no câncer colorretal na literatura.

Conclusões

A nossa descoberta de novos exão 4 mutações KRAS que são, até agora, única para pacientes com câncer colorretal sauditas pode ser atribuída a fatores ambientais e /ou variações raciais /étnicas, devido a diferenças genéticas. Alternativamente, pode estar relacionada com a escassez de estudos clínicos em pessoas que, nos códons 12, 13, 61 e 146. Mais KRAS de testes em um grande número de pacientes de diversas etnias, em especial para além dos alelos hotspot mais comuns nos exons 2 e mutações 3 é necessária para avaliar a prevalência e explorar o significado prognóstico e preditivo exacto das novas mutações descobertas, bem como seu possível papel na carcinogênese colorretal

Citation:. Naser WM, Shawarby MA, Al-Tamimi DM, Seth A, al-Quorain A, Nemer AMA, et ai. (2014) Novos KRAS Gene As mutações no câncer colorretal esporádico. PLoS ONE 9 (11): e113350. doi: 10.1371 /journal.pone.0113350

editor: Klaus Brusgaard, Hospital Universitário de Odense, Dinamarca

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