Abstract

Em pacientes com câncer de cólon metastático, a resposta à quimioterapia de primeira linha é um forte preditor de sobrevida global (OS). Atualmente, oncologistas faltam testes de diagnóstico para determinar quais regime de quimioterapia oferece a maior chance de resposta em um paciente individual. Aqui nós apresentamos os resultados da análise de expressão gênica por dois genes, ERCC1 e TS, medida com a ResponseDX disponíveis comercialmente: ensaio de Colon (Response Genetics, Los Angeles, CA) em 41 pacientes com de novo câncer de cólon metastático diagnosticados entre julho de 2008 e agosto 2013, da Universidade da Califórnia, San Diego. Em ERCC1 adição e níveis de expressão de TS, conforme determinado pela RNA-Seq e dados de sobrevivência para pacientes em TCGA foram baixadas a partir do portal de dados TCGA. Descobrimos que pacientes com baixa expressão de ERCC1 (n = 33) tinham significativamente mais tempo mediano OS (36,0 vs. 10,1 mo, HR 0,29, 95% CI ,095-,84, log-rank p = 9.0×10

-6 ) e tempo médio para o tratamento ao fracasso (TTF), após quimioterapia de primeira linha (CI 14,1 vs. 2,4 meses, HR 0,17, 95% 0,048 a 0,58, log-rank p = 5.3×10

-4) em relação àqueles com alta expressão (n = 4). Após a contabilização para o co-variáveis ​​idade, sexo, grau do tumor e performance status ECOG em um modelo de riscos proporcionais de Cox a associação de baixo ERCC1 com mais OS (HR 0,18; IC 95% 0,14-0,26, p = 0,0448) e TTF (HR 0,16, 95% CI 0,14-0,21, p = 0,0053) permaneceu significativo. Os pacientes com baixa expressão TS (n = 29) tiveram OS significativamente maior mediana (36,0 vs. 14,8 mo, HR 0,25, 95% CI 0,074 para 0,82, log-rank p = 0,022) em relação àqueles com alta expressão (n = 12) . A baixa expressão combinada de ERCC1 /TS foi preditivo de resposta em pacientes tratados com FOLFOX (40% vs. 91%, RR 2,3, o teste exato de Fisher p = 0,03, n = 27), mas não com FOLFIRI (71% vs. 71 %, RR 1,0, teste exato de Fisher p = 1, n = 14). No geral, estes resultados sugerem que a medição de expressão ERCC1 e TS tem utilidade clínica potencial no tratamento de pacientes com câncer colorretal metastático

Citation:. Choueiri MB, Shen JP, Bruta AM, Huang JK, Ideker T, Fanta P ( 2015) ERCC1 e TS expressão como prognósticos e preditivos Biomarkers em cancro do cólon metastático. PLoS ONE 10 (6): e0126898. doi: 10.1371 /journal.pone.0126898

Editor do Academic: Anthony Federação das Índias Ocidentais Lo, Queen Mary Hospital, HONG KONG

Recebido: 05 de janeiro de 2015; Aceito: 08 de abril de 2015; Publicação: 17 de junho de 2015

Direitos de autor: © 2015 Choueiri et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Disponibilidade de dados: Todos os dados relevantes estão dentro do papel e seus arquivos de suporte de informação com excepção dos dados de TCGA, que podem ser acessados ​​em qualquer Broad Firehose (https://confluence.broadinstitute.org/display/GDAC/Home) ou TCGA Portal de dados (https: //tcga-data.nci.nih.gov/tcga)

Financiamento:. Sociedade americana de Oncologia Clínica: www.asco.org, Jovem Investigator Award para JPS, Marsha Rivkin Centro de Pesquisa do Câncer de ovário: www.marsharivkin .org, Scholar Award Científico para JPS, Estados Unidos National Institutes of Health: www.nih.gov, R01 ES014811 de TI, U24 CA184427 para TI Os financiadores não tiveram nenhum papel no desenho do estudo, coleta de dados e análise, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO DE INTERESSES:.. Os autores declararam que não existem interesses conflitantes

Introdução cancer

colorectal continua a ser o terceiro câncer mais mortal nos Estados Unidos, com uma incidência estimada de 132,700 novos casos e 49.700 mortes em 2015. a introdução de novos agentes citotóxicos e direcionados para pacientes com metástases CRC (mCRC) melhorou globalmente sobrevivência (SO) taxas, com sobrevida média esperada agora em excesso de 20 meses com muitos pacientes que sobreviveram por mais de dois anos [1]. O paradigma de tratamento actual consiste em 5-fluorouracilo regimes baseados em combinação com oxaliplatina (FOLFOX) ou irinotecano (Folfiri), potencialmente combinados com terapia de segmentação EGFR ou VEGFR [2]. Anteriores, grandes ensaios clínicos prospectivos têm demonstrado que, quando usado como opções de terapia de primeira linha, as taxas de resposta (RR), quer para FOLFOX ou FOLFIRI são em torno de 55% [3]. Actualmente, os oncologistas têm limitado a ferramentas de diagnóstico para prever quais opção quimioterapia de primeira linha é melhor para um paciente individual. Escolha de uma terapia de primeira linha é de grande importância em CCRm como tem sido mostrado que os pacientes que respondem à terapia de primeira linha tem mais OS [4], e alguns destes doentes com doença oligometastatic pode continuar a passar por metastatectomy com finalidade curativa [5] .

Muitos biomarcadores preditivos potenciais para CCRm têm sido relatados, usando uma variedade de tipos de dados moleculares [6-8]. Estes marcadores incluem o status de mutação do KRAS [9, 10], BRAF [11, 12] e TP53 [13-15]. Outros marcadores de prognóstico incluem a instabilidade microssatélite (MSI) [16, 17], receptor do factor de crescimento epidérmico (EGFR) do número de cópias [18], 18q alélica desequilíbrio, a expressão do gene TP53, bem como os níveis de timidilato-sintase (TS) [13, 19 expressão ] e Excision Repair Cross-Complementação Grupo 1 (ERCC1) [6, 20]. No entanto, fora da exceção do estado de mutação KRAS previsão da resposta ao anti-EGFR anticorpos cetuximab e panitumumab, o valor clínico demonstrou de outros biomarcadores tem sido limitada [21, 22].

ERCC1 e os níveis de expressão de TS foram previamente descrito como biomarcadores potencialmente promissores em CCRm [23]. ERCC1 é conhecido por estar envolvido na excisão de nucleótidos e a via de reparação, uma parte da resposta celular a danos no ADN. Os pacientes com baixos níveis de expressão ERCC1 foram relatados para ter uma melhor resposta e um sistema operacional já em tumores gastrointestinais tratados com FOLFOX [23-26]. TS é uma enzima responsável pela geração de trifosfato de desoxitimidina (dTMP), que é necessária para a formação da timina ácido nucleico. Mais notavelmente, TS é o alvo do antimetabolito utilizada 5-fluorouracilo (5-FU). a expressão do gene TS foi mostrado para ser preditivo de resposta à terapia baseada em 5-FU em doentes com CCRm [27-30]. Os baixos níveis de TS foram também correlacionada com uma melhor taxa de resposta e o sistema operativo, em doentes tratados com FOLFOX, mas não tinha valor prognóstico em pacientes tratados com Folfiri [23, 27, 30]. Porque a expressão do gene é uma variável contínua, para fins de diagnóstico, é importante para estabelecer um nível limite que define uma população de elevada expressão e uma população distinta com baixa expressão. Para ERCC1, valores de limiar ter sido sugerido com base na resposta à quimioterapia à base de platina no cólon, gástrico, de cabeça /pescoço, bexiga e cancro do pulmão de não-pequenas células [23]. Específico para mCRC, confirmam-1 e -2 ensaios incluíram 122 doentes com CCRm e estabeleceu a utilidade clínica dos limites existentes para alta vs. baixa ERCC1 e expressão do gene TS como medido por qPCR e normalizada contra actina [6]. Nesses estudos, os pacientes com altos TS e /ou alta ERCC1 mostrou um menor OS de 15,6 meses, em comparação a 37 meses em pacientes que tiveram baixos níveis de expressão de ambos os genes.

Tendo em conta estes dados, nós incorporamos a nossa instituição medição de rotina da expressão ERCC1 e TS como parte do tratamento padrão para pacientes com CCRm. Aqui nós revemos nossa coorte única instituição de pacientes com mCRC de novo, bem como uma coorte de The Cancer Genome Atlas (TCGA) para avaliar a utilidade clínica do ERCC1 e /ou níveis de expressão do gene de expressão TS.

Materiais e métodos

design estudo

Para este estudo, foi realizada uma análise retrospectiva em duas coortes de pacientes com ERCC1 conhecida e os níveis de expressão de TS. O tempo de tratamento ao fracasso (TTF) para quimioterapia de primeira linha foi escolhida como desfecho primário. Os desfechos secundários incluíram a taxa de resposta objectiva (ORR) para terapia e OS. TTF foi calculado a partir do início do tratamento com qualquer um ou FOLFOX Folfiri até evidência clínica ou radiológica de progressão. OS foi calculado a partir do momento do início do tratamento até a morte por qualquer causa. ORR foi calculada como a soma das respostas completas ou parciais, determinados pela melhoria em qualquer imagens em série ou série de medição biomarcador. Os critérios de elegibilidade foram definidos da seguinte forma: o diagnóstico patológico de mCRC, primeira linha de tratamento com FOLFOX-6 ou FOLFIRI, imagem com tomografia computadorizada (TC) no prazo máximo de três meses após o início da terapia. Os critérios de exclusão incluíram quimioterapia adjuvante prévia, co-morbidades avançados definidos como infarto recente do miocárdio ou angina instável, descontrolada hipertensão ou diabetes mellitus, insuficiência renal ou hepática. Também foram excluídos pacientes com prontuários incompletos ou indisponíveis. Os doentes tratados com bevacizumab concomitante ou cetuximab em adição à quimioterapia citotóxica foram incluídos na análise. A UCSD Institutional Review Board aprovou este estudo. Dada a sua natureza retrospectiva que não represente mais de um risco mínimo para os sujeitos, portanto acordo com o Código de Regulamentos Federais sobre a Protecção dos Direitos Assuntos foi concedida uma dispensa de consentimento informado. Os dados para TCGA coorte foram obtidos a partir do site Firehose o Genoma Data Analysis Center (GDAC). Todos os dados foram descarregados a partir dos dados padrão de 15 de Janeiro de 2014 e analisa prazo

Análise Molecular

O ResponseDX:. Ensaio Colon inclui PCR quantitativo para medir a expressão do gene para ERCC1, TS, e VEGFR bem mutações tão específicos. O DNA extraído foi utilizado para detectar mutações no exão 2 de KRAS utilizando PCR com iniciadores específicos de mutações conhecidas [18]. Os valores-limite para as medições de expressão de genes normalizados utilizados para estratificar pacientes em grupos de expressão altas ou baixas foram de 4,0 e 1,73 por TS e ERCC1, respectivamente. Estes valores de limiar tenham sido previamente estabelecida e usada nos ensaios CONFIRMAR-1 e confirme-2 [6]. funções de Kaplan-Meier foram utilizados para estimar as probabilidades de sobrevivência. medição de expressão génica para os pacientes TCGA foi realizado usando RNA-Seq, como descrito [31]. Porque não havia nenhum limite antes estabelecido para ERCC1 ou níveis TS medido pela RNA-Seq, por TCGA coorte o valor médio da ERCC1 e TS foi usado como limiar.

Análise Estatística

Análise do TTF e OS as curvas foram realizadas utilizando o método de Kaplan-Meier e relatados como taxa de risco (HR), a significância das diferenças entre os grupos foi avaliada utilizando o método de log-rank. As diferenças na distribuição das variáveis ​​categóricas foram avaliadas através de X

2 teste de Pearson. Diferenças na ORR são relatados como risco relativo (RR), a significância foi testada usando o teste exato de 2 faces de Fisher. Cox análise de regressão múltipla de TTF e OS foi usado para avaliar a contribuição de idade, sexo, grau do tumor e performance status ECOG. A correlação entre ERCC1 e TS foi calculada utilizando teste bicaudal de Pearson R. cálculo estatístico foi realizado utilizando GraphPad Prism versão 6.04 e OriginPro 2015.

Resultados

características clínicas e moleculares

Os registros clínicos de pacientes com mCRC de novo tratados no nosso centro entre julho de 2008 e agosto de 2013, foram revistos. Cinquenta pacientes que tiveram seus tumores testados pela ResponseDX: Colon (Response Genetics, Los Angeles, CA) como parte do atendimento clínico de rotina foram identificados, 41 preencheram os critérios de elegibilidade e foram incluídos na análise final (Tabela 1). características do paciente completo estão resumidos na Tabela S1. Dezoito pacientes eram do sexo masculino (44%) e 23 eram do sexo feminino (56%). A idade média foi de 57,6 anos, com intervalo de 31 a 86. Vinte e quatro (59%) dos pacientes foram submetidos a cirurgia para o tumor primário e 12 (29%) foram submetidos a um metastatectomy durante o curso do seu tratamento. A maioria dos pacientes foram tratados com primeira linha FOLFOX (66%), recebendo uma média de 9,5 doses com intervalo de 2-20. Aproximadamente um terço dos pacientes foram tratados com primeira linha FOLFIRI (34%), recebendo uma média de 8,5 doses com intervalo de 2-14. Antes do início do tratamento, 93% dos pacientes tinham um estatuto de 0 ou 1. Todos os pacientes desempenho ECOG foram avaliados para ERCC1 e expressão de TS e estado de mutação KRAS. Usando valores de corte pré-estabelecidos, 37 pacientes (90%) tinham níveis baixos de expressão ERCC1 e 29 pacientes (71%) tinham baixos níveis de expressão de TS. ERCC1 expressão mediana para e TS foi de 1,13 e 2,65, respectivamente. Vinte e dois pacientes (54%) tinham mutações no KRAS.

TCGA coorte

Os dados clínicos e moleculares de um segundo grupo de pacientes foi obtido a partir TCGA. No total, 6202 pacientes em uma coorte pan-câncer, incluindo 62 pacientes com mCRC tinha dados para tanto a expressão OS e gene. TTF e taxa de resposta não eram conhecidos para todos os pacientes na coorte TCGA modo análise foi restrita aos OS. Na coorte pan-câncer de todos os 6202 pacientes TCGA, houve mínima diferença na sobrevida média entre os pacientes com níveis baixos e altos de ERCC1 (87,2 vs. 82,9 mo, HR 0,95, 95% intervalo de confiança [CI]: 0,86 a 1,05, p = 0,009) (Figura 1A). Os pacientes com baixos níveis de TS tinha um sistema operacional mais tempo mediano em comparação aos pacientes com níveis elevados de TS (102 vs 69,8 meses, HR 0,61, 95% CI: 0,55-0,68, log-rank p 10

-9) (Fig 1B ). O efeito da ERCC1 foi ampliada através da restrição da coorte paciente apenas os 1835 pacientes que receberam quimioterapia adjuvante (79,3 mo OS mediana para baixo ERCC1 vs. 54,9 em alta ERCC1, HR 0,72, 95% CI: 0,61-0,85, p = 0,0001) . Na coorte de todos os 62 pacientes com CCRm de TCGA, o efeito da expressão ERCC1 no OS mediana não foi significativa (ainda não-alcançados em pacientes com baixa ERCC1 vs. 39,5 mo em pacientes com alta ERCC1, HR 0,96, 95% CI: 0,39-2,4, p = 0,93), com taxa de risco semelhante ao da coorte pan-cancro (Fig 1C). Da mesma forma, não houve associação significativa de expressão TS com OS no total coorte TCGA mCRC (HR 0,98; IC 95%: 0,35-2,7, p = 0,96) (Fig 1D). Entre os 27 pacientes com CCRm tratados com oxaliplatina, a taxa de risco para baixo ERCC1 foi um quarto da de toda a coorte mCRC; pacientes com baixa ERCC1 teve OS mediana ainda-não-atingido vs. 39,5 meses para aqueles com alta ERCC1 (HR 0,22; IC 95%: 0,045 a 1,5, p = 0,13) (Fig 1E). Não houve diferença na sobrevida entre os pacientes com baixos TS e alta expressão de TS nesta população (HR 0,77, 95% CI: 0,12-4,8, p = 0,77). (Fig 1F)

(A) OS de todos pacientes em TCGA estratificada por expressão ERCC1. (B) OS de todos os pacientes em TCGA estratificados por expressão TS. (C) OS de todos os pacientes com CCRm de TCGA estratificados por expressão ERCC1. (D) OS de todos os pacientes com CCRm de TCGA estratificados por expressão TS. (E) OS somente dos pacientes com CCRm tratada oxaliplatina estratificada por expressão ERCC1. (F) OS somente dos pacientes com CCRm tratados oxaliplatina estratificada por expressão TS

UCSD Cohort, ERCC1

Trinta e sete pacientes tinham níveis de expressão ERCC1 abaixo do ponto de corte de 1,73.; apenas 4 pacientes tinham níveis ERCC1 acima deste limiar. Pacientes com baixa ERCC1 tinha uma tendência para uma maior ORR com qualquer quimioterapia do que aqueles com alta ERCC1 (83% vs 50%, RR de 0,60, IC de 95%: 0,22-1,6, p exacto de Fisher = 0,16) (Tabela 2). OS mediana foi significativamente maior nos pacientes com baixa ERCC1 (36,0 vs. 10,1 mo, HR 0,29; IC 95%: 0,095-0,84, log-rank p = 9.0×10

-6) (Fig 2A). TTF médio também já não era para pacientes com baixa ERCC1 (14,1 vs. 2,4 meses, HR 0,17, 95% CI ,048-,58, log-rank p = 5.3×10

-4) (Fig 2B). Após a contabilização para o co-variáveis ​​idade, sexo, grau do tumor e performance status ECOG em um modelo de riscos proporcionais de Cox a associação de baixo ERCC1 com mais OS (HR 0,18; IC 95% 0,14-0,26, p = 0,0448) e TTF (HR 0,16, 95% CI 0,14-0,21, p = 0,0053) permaneceu significativo. Entre os 37 pacientes com baixa ERCC1, 24 receberam tratamento com FOLFOX e 13 receberam FOLFIRI. Aqueles tratados com FOLFOX mostrou tendência de mais longo mediana OS em relação ao FOLFIRI (36,0 vs. 22,6 meses, HR 0,91, IC 95%: 0,32 a 2,4, p = 0,83), mas a diferença não atingiu significância estatística. Em pacientes com baixa ERCC1, a TRG a FOLFOX foi de 86% em comparação com 72% para FOLFIRI (RR 1,3, IC 95%: 0,78 a 2,1, p exato de Fisher = 0,25).

(A) OS em todos pacientes estratificados por expressão ERCC1. (B) TTF em todos os pacientes estratificados por expressão ERCC1. (C) OS em todos os pacientes estratificados por expressão TS. (D) TTF em todos os pacientes estratificados por expressão TS

UCSD Cohort, TS

Vinte e nove pacientes tiveram expressão TS menos do que o valor limite 4.0.; doze tinham níveis de expressão acima deste limiar. O OS mediana foi significativamente maior para os pacientes com baixa expressão TS (36,0 mo vs 14,8 meses, HR 0,37, 95% CI: 0,076 e 0,80, log-rank p = 0,022) (Fig 2C). No entanto, após o controle de co-variáveis ​​em um modelo de Cox a associação de OS com TS não foi mais significativa (HR 0,47; IC 95%: 0,31 a 0,94, p = 0,16), sendo substituída por uma associação entre o estado de desempenho ECOG e sobrevivência (HR 0,35 , 95% CI: 0,28-0,48, p = 0,006). Houve uma ligeira tendência na mesma direção para TTF mediana no grupo de baixa expressão TS ao grupo alta expressão (mo 12,3 vs.11.7, HR 0,82; IC 95%: 0,33 a 2,0, a Log-rank p = 0,18), que fez não atingiu significância estatística. (Figura 2D). A TRG para qualquer terapia nos pacientes com baixos TS foi de 86% em comparação com 58% no grupo de alto nível TS. (RR 0,68, 95% CI: 0,41 para 1,1, p exato de Fisher = 0,10) (Tabela 2)

UCSD Cohort, ERCC1 /TS Combinação

em seguida, avaliamos se ERCC1 e TS podem ser combinados para formar um marcador composto capaz de identificar sub-populações com diferenças significativas em TTF, Orr e OS. Vinte e nove pacientes tinham níveis baixos de expressão tanto ERCC1 e TS, oito tiveram baixos níveis de expressão de TS elevada mas ERCC1, e quatro pacientes tinham níveis elevados de ambos ERCC1 e TS. Nenhum paciente apresentou a combinação de alta ERCC1 com baixos TS. Interessantemente, os níveis de expressão de TS ERCC1 e foram correlacionados significativamente (Pearson

R

= 0,53; p = 0,0004) (Fig 3A). Pacientes com alta ERCC1 e TS teve o TTF mais curto de apenas 2,4 meses, em comparação com 14,1 meses em pacientes com baixa ERCC1 e altas TS e 15,5 meses em pacientes com baixos níveis de ERCC1 e TS (Fig 3B). A diferença de TTF médio entre o baixo ERCC1 de baixa TS coorte em relação às altas TS ERCC1 de alta (IC 15,5 vs. 2,4 meses, HR 0,17, 95% 0,0012-,11, log-rank p = 4.6×10

-4) foi estatisticamente significativa e permaneceu significativa após o controle para co-variáveis ​​(HR 0,13, 95% CI: 0,11-,16, p = 0,0029). Tendências semelhantes foram observados com OS, pacientes de alto ERCC1 de alta TS com o mais curto OS mediana de 10 meses em comparação com 15 meses para baixo TS ERCC1 de alta e 36 meses para baixo TS ERCC1-baixo. A diferença na sobrevida média entre o baixo ERCC1 de baixa TS coorte em relação às altas TS ERCC1 de alta (36 vs. 10 mo, HR 0,10, 95% CI 3.4×10

-5 a 0,0088, log-rank p = 3.8×10

-7) também foi estatisticamente significativa e assim permaneceu após o controle para co-variáveis ​​(HR 0,092, IC 95%:. ,078-,11, p = 0,014)

(a) Correlação entre ERCC1 e expressão TS. (B) Tempo para falha do tratamento de todos os pacientes por combinação de ERCC1 /TS. (B) A sobrevida global de todos os pacientes por combinação de ERCC1 /TS

Os pacientes com um nível elevado de ambos ERCC1 e TS teve uma tendência para menor TRG de 50% em comparação com 63% em pacientes com baixa ERCC1 /altas TS e 86% em pacientes com níveis baixos de ambos os marcadores (Tabela 2). Pacientes com baixa expressão de ambos ERCC1 e TS teve uma taxa de resposta particularmente alta de 91% quando tratados com FOLFOX. Entre todos os pacientes tratados com FOLFOX aqueles com uma expressão dual de baixo teve uma taxa de resposta mais elevada em relação àqueles com alta expressão de um ou ambos ERCC1 /TS (40% vs. 91%, RR 2,3, IC 95%: 0,77 a 6,7, exato de Fisher teste de p = 0,03, n = 27). O ERCC1 combinado /TS biomarcador não foi preditiva de resposta ao FOLFIRI (71% vs. 71%, RR = 1,0, teste exato de Fisher p = 1, n = 14) (Tabela 3). Todos, exceto um dos pacientes que passaram a sofrer metastatectomy tiveram baixa expressão de ambos os genes. A taxa de metastatectomy em pacientes com elevada expressão de qualquer gene foi de 8,3% (1/11), em comparação com 27% (10/27) para aqueles com dupla expressão baixa (RR 3,2, IC de 95%: 0,46-23, Fisher p exata = 0,252).

Discussão

Conseguir uma resposta clínica à terapia de primeira linha é de importância crítica no mCRC, uma vez que é sabido que muitos desses pacientes não vai estar apto a tolerar uma combinação de medicamentos quimioterápicos citotóxicos na segunda linha devido ao declínio na performance status. E FOLFOX Folfiri, os dois principais regimes de base de quimioterapia utilizados para tratar CCRm foram mostrados para ter taxas de resposta equivalentes quando média entre um grande grupo de pacientes com CCRm [3]. No entanto, dada a diversidade molecular tremenda entre diferentes tumores do cólon individuais [31], presumivelmente existem subconjuntos de tumores com maior probabilidade de resposta a um regime do que o outro. No entanto, para os pacientes com câncer de cólon metastático, atualmente, a maioria de quimioterapia citotóxica é dado sem qualquer biomarcador para prever a resposta. Foi o objetivo deste estudo para investigar se os dados moleculares do comercialmente disponível a expressão do gene e mutação painel ResponseDx Colon poderia ser usado para prever a resposta e TTF à terapia de primeira linha.

O desenho do estudo foi inerentemente limitado pelo seu desenho retrospectivo e tamanho da amostra modesto, e foi ainda limitado pela menor do que o esperado número de pacientes com expressão elevada ERCC1. Deve-se notar que utilizado anteriormente estabelecido para cortes de ERCC1 e TS [6]. Devido a essas limitações do estudo foi desenhado para detectar apenas particularmente grandes magnitudes de efeitos com significância estatística. Apesar destas limitações, uma observação de potencial importância clínica pode ser feito que pacientes com baixos níveis de ERCC1 e TS teve uma taxa de resposta extraordinariamente elevado de 91% (20/22) para FOLFOX. É difícil fazer uma comparação direta com a taxa de resposta FOLFIRI de 71% (5/7) dado o pequeno tamanho da amostra, no entanto, se essas taxas de resposta são confirmados em estudos maiores este achado sugere que, na ausência de contra-indicações à terapia de platina , FOLFOX pode ser a primeira linha de tratamento preferido nestes pacientes. Estes pacientes com baixa ERCC1 e expressão TS tinha um TTF significativamente maior em relação aos pacientes com elevada expressão para um ou ambos os genes independentemente de se eles foram dadas primeira linha FOLFOX ou FOLFIRI, sugerindo baixa expressão dual de ERCC1 /TS pode ser um marcador de general quimio-sensibilidade em vez de especificamente sensibilidade platina.

Os doze pacientes com tumores que expressam elevados níveis de ambos os TS ou ERCC1 de tendência no sentido de taxa de resposta pior em relação àqueles com uma expressão dual baixa. A magnitude da diferença seria clinicamente significativo se confirmada em estudos maiores, no entanto, devido à dimensão limitada da amostra não atingiu significância estatística neste estudo. Curiosamente a taxa de resposta ao Folfiri foi a mesma para os tumores com expressão dupla baixo e aqueles com elevada expressão de um ou ambos ERCC1 ou TS. Em contraste, a taxa de resposta a FOLFOX era de apenas 40% (2/5) para tumores com expressão elevada de um ou ambos ERCC1 ou TS. Embora conclusões sobre uma amostra deste tamanho devem ser tratados com cautela, estes resultados suportam FOLFIRI como quimioterapia de primeira linha para tumores com alta expressão de qualquer ERCC1 ou TS. Com cuidado semelhante é relatado o prognóstico sombrio dos quatro pacientes com alta expressão de ambos ERCC1 e TS, tendo TTF de apenas 2,4 meses e OS de 10 meses. Não houve pacientes com alta ERCC1 e baixos ts, de maneira a contribuição relativa de ERCC1 e TS para este observada prognóstico pobre não pode ser avaliada neste estudo. Houve apenas um paciente com alta ERCC1 e altas TS em nossa coorte, que foi tratada com FOLFIRI, e este paciente não respondeu, potencialmente sugerindo que a elevação concomitante na expressão ERCC1 e TS confere resistência a vários tipos de quimioterapia.

Nós examinaram a associação de expressão ERCC1 e TS com o oS em TCGA pan-câncer e coortes CCRm para ver se as tendências observadas seria generalizar a estes coortes independentes. Para ERCC1 houve uma ligeira tendência para piores OS com alta expressão em ambos pan-câncer e coortes CCRm, cuja magnitude foi exagerada em pacientes tratados com quimioterapia platina. Este resultado é consistente com a função conhecida de ERCC1 na reparação do ADN após a terapia de platina. Para TS houve significativamente pior OS com elevada expressão na coorte pan-TCGA cancro, mas este efeito não foi visto na coorte CCRm.

Em conclusão, este estudo demonstra a utilidade potencial da expressão do gene ERCC1 e TS como biomarcadores de prognóstico e possivelmente preditivos em mCRC, consistentes com estudos anteriores [6]. Ele identifica uma população com mau prognóstico (alta ERCC1 /expressão TS), bem como uma população com um notavelmente elevada taxa de resposta ao FOLFOX quimioterapia (baixo ERCC1 /expressão TS). No futuro, o valor prognóstico e preditivo da expressão ERCC1 e TS deve ser examinada no contexto de um ensaio clínico prospectivo maior.

Informações de Apoio

Tabela S1. . As características dos pacientes

Tabela mostrando demográfica, histológica, e dados de tratamento moleculares para os 41 pacientes incluídos na coorte UCSD

doi:. 10.1371 /journal.pone.0126898.s001

(XLSX)

Reconhecimentos

O financiamento da investigação à PF em parte através do generoso apoio de Arthur Athans em nome de sua esposa, Barbara Mae Athans. Estamos gratos pelo apoio para este estudo a partir dos Estados Unidos National Institutes of Health (R01 ES014811 e U24 CA184427 a T.I.). J.P.S. foi apoiada por doações do Rivkin Centro de Marsha para Pesquisa do Câncer de ovário e uma Fundação Conquer Cancer da ASCO Young Investigator Award.