PLOS ONE: Colorectal Cancer Linkage em cromossomas 4q21, 8q13, 12q24 e 15q22

Abstract

Uma proporção substancial de cancro colorectal familial (CRC) não é uma consequência do loci de susceptibilidade conhecidos, tais como reparação de incompatibilidade de genes (MMR), apoiando a existência de loci adicionais. Para identificar novos loci CRC, foi realizada uma varredura de ligação do genoma em 356 famílias brancas, sem evidência de MMR com defeito (ou seja, sem perda de expressão tumoral das proteínas MMR, nenhuma instabilidade de microssatélites (MSI) tumores -High, ou nenhuma evidência de ligação com genes MMR). Famílias foram apurados através do consórcio de Registro Familiar Cancer multi-site Colon NCI-suportado (Colon CFR), o City of Hope Comprehensive Cancer Center e Universidade Memorial de Newfoundland. Um total de 1.612 indivíduos (média de 5,0 por família, incluindo 2,2 afetado) foram genotipados usando matrizes polimorfismo de nucleotídeo único de todo o genoma; paramétricos e análise de ligação não paramétrico utilizado MERLIN no

a priori

grupos familiares -definida. Cinco pontuações lod superior a 3,0 foram observados assumindo heterogeneidade. A maior estavam entre as famílias com idade média de diagnóstico menos de 50 anos em 4q21.1 (Hlod dominante = 4,51, α = 0,84, 145.40 cM, rs10518142) e entre todas as famílias em 12q24.32 (Hlod dominante = 3,60, α = 0,48 , 285.15 cm, rs952093). Entre as famílias com quatro ou mais indivíduos afetados e entre famílias baseadas na clínica, um pico comum foi observado em 15q22.31 (101,40 cm, rs1477798; Hlod dominante = 3,07, a = 0,29; Hlod dominante = 3,03, a = 0,32, respectivamente) . Análise de famílias com apenas dois indivíduos afetados produziu um pico em 8q13.2 (Hlod recessivo = 3,02, α = 0,51, 132,52 cM, rs1319036). Estes picos de ligação anteriormente não declarada demonstrar a utilidade continuada de dados de base familiar em características complexas e sugerem que novos alelos de risco CRC permanecem a ser elucidados

Citation:. Cicek MS, Cunningham JM, Fridley BL, Serie DJ, Bamlet WR, Diergaarde B, et al. (2012) Colorectal Cancer Linkage em cromossomas 4q21, 8q13, 12q24 e 15q22. PLoS ONE 7 (5): e38175. doi: 10.1371 /journal.pone.0038175

editor: Anthony W. I. Lo, da Universidade Chinesa de Hong Kong, Hong Kong

Recebido: 14 Março, 2012; Aceito: 01 de maio de 2012; Publicado em: 31 de maio de 2012

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