PLOS ONE: Investigação de radiossensibilidade Gene assinaturas em linhas celulares de cancro

Abstract

radiossensibilidade intrínseco é um fator importante subjacente a resposta à radioterapia, mas não há nenhum método para a sua avaliação de rotina em tumores humanos. assinaturas de genes estão sendo derivada e alguns foram gerados anteriormente pelo perfil de expressão do painel de linha celular NCI-60. Foi colocada a hipótese de que se concentrar em tipos de tumores mais homogéneos seria uma melhor abordagem. Duas coortes de linhas celulares foram usados ​​derivados de colo do útero [n = 16] e cabeça e pescoço [n = 11] cânceres. Radiossensibilidade foi medido como fracção sobrevivente após irradiação com 2 Gy (SF2) pelo ensaio clonogénico. expressão gênica diferencial entre linhas celulares radiossensíveis e radioresistentes (SF2 / mediana) foi investigado usando Affymetrix GeneChip Exon 1.0ST (colo do útero) ou U133A Plus2 (cabeça e pescoço) arrays. Havia diferenças dentro de coortes de linhas celulares, relativamente ao tecido de origem reflectido pela expressão do marcador p63 estratificada epitelial. De 138 genes identificados como estando associado com SF2, apenas 2 (1,4%) foram coerentes entre o colo e da cabeça e linhas celulares de carcinoma do pescoço (MGST1 e TFPI), e estes não particionar as linhas celulares NCI-60 publicados baseados em SF2. Houve sucesso variável na aplicação de três assinaturas radiossensibilidade publicados aos nossos companheiros. Uma assinatura de genes, originalmente formado nas linhas celulares NCI-60, fez linhas de células sensíveis e resistentes parcialmente separados em todos os três conjuntos de dados de linha de células. Os resultados não confirmam a nossa hipótese, mas sugerem que uma assinatura da transcrição comum pode refletir a radiossensibilidade de tumores de origem heterogênea

Citation:. Salão JS, AIPT R, Senra J, Taylor J, Armenoult L, Oguejiofor K, et ai. (2014) Investigação de radiossensibilidade Gene Assinaturas em linhas celulares de cancro. PLoS ONE 9 (1): e86329. doi: 10.1371 /journal.pone.0086329

editor: Olivier Gires, Universidade Ludwig-Maximilians, Alemanha

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