Abstract

Fundo

Os lipídios têm funções críticas em armazenamento de energia celular, estrutura e sinalização. Muitas moléculas de lípidos individuais têm sido associados com a evolução do cancro da próstata; no entanto, nenhum deles tem sido aprovado para ser utilizado como um biomarcador. O objetivo deste estudo é identificar moléculas lipídicas a partir de espécies aparente lipídicas centenas de plasma como biomarcadores para o diagnóstico de câncer de próstata.

Metodologia /Principais Achados

Usando lipidomics, perfil lipídico de 390 lipídico aparente indivíduo espécies foi realizada em 141 amostras de plasma de 105 pacientes com câncer de próstata e 36 controles do sexo masculino. dados de alta produtividade gerados a partir lipidomics foram analisados ​​utilizando métodos de bioinformática e estatísticos. A partir de 390 espécies de lípidos aparentes, 35 espécies foram demonstradas como tendo um potencial na diferenciação de cancro da próstata. Dentro das 35 espécies, 12 foram identificados como biomarcadores de lipídios plasmáticos individuais para o diagnóstico de câncer de próstata com uma sensibilidade superior a 80%, a especificidade acima de 50% e precisão acima de 80%. Usando top 15 de 35 potenciais biomarcadores em conjunto aumentaram dramaticamente poder preditivo no diagnóstico do câncer de próstata com uma sensibilidade de 93,6%, especificidade de 90,1% e acurácia de 97,3%. Análise de Componentes Principais (PCA) e análise de agrupamento hierárquico (HCA) demonstraram que populações de pacientes e controle foram visualmente separados por biomarcadores lipídicos identificados. As análises Floresta aleatória e 10 vezes validação cruzada demonstraram que os biomarcadores identificados lípidos foram capazes de prever as populações desconhecidos com precisão, e isto não foi influenciada pela idade e de raça do paciente. Três das 13 classes de lípidos, fosfatidiletanolamina (PE), fosfatidiletanolamina ligados a éter (EPE) e fosfatidilcolina ligados a éter (EPC) pode ser considerado como biomarcadores no diagnóstico de câncer de próstata.

Conclusões /Significado

Usando lipidomics e bioinformática e métodos estatísticos, foram identificados alguns para fora de centenas de plasma espécies moleculares lipídicas aparentes como biomarcadores para o diagnóstico de câncer de próstata com uma alta sensibilidade, especificidade e acurácia

Citation:. Zhou X , Mao J, ai J, Deng Y, Roth MR, Pound C, et al. (2012) Identificação de Plasma Lipid Biomarkers para cancro da próstata por Lipidomics e Bioinformática. PLoS ONE 7 (11): e48889. doi: 10.1371 /journal.pone.0048889

Autor: Christina Lynn Addison, Instituto de Pesquisa Hospital Ottawa, Canadá