microRNAs

Abstract

Introdução

Um número crescente de estudos investigaram (miRNAs) como potenciais marcadores de diagnóstico, tratamento e prognóstico. Até agora, o acordo entre os estudos tem sido mínima, o que pode em parte ser explicada pela heterogeneidade intratumoral de expressão miRNA. O objetivo do presente estudo foi avaliar a heterogeneidade de um painel de miRNAs selecionados no cancro rectal, utilizando duas abordagens técnicas diferentes.

Materiais e Métodos

Foi analisada a expressão dos miRNAs investigados pela reação em tempo real em cadeia da polimerase quantitativa (RT-qPCR) e

in situ

hibridação (ISH) em amostras de tumores de 27 pacientes com câncer retal T3-4. A partir de cada tumor, foi examinado o tecido de três localizações diferentes luminais. variabilidade inter e intra-paciente foi avaliada calculando coeficientes de correlação intraclasse (CCI). Correlações entre RT-qPCR e ISH foram avaliadas por meio de correlação de Spearman.

Resultados

ICC

simples (uma amostra de cada paciente) foi superior a 50% para o miRNA-21 e miRNA- 31. Para miARN-125b, miARN-145, e miARN-630, TPI

único foi inferior a 50%. O CCI

média (média de três amostras de cada paciente) foi maior do que 50% de miARN-21 (RT-qPCR e ISH), miARN-125b (RT-qPCR e ISH), miARN-145 (ISH), miARN-630 (RT-qPCR), e miARN-31 (RT-qPCR). Para miARN-145 (RT-qPCR) e miARN-630 (ISH), CCI

média era inferior a 50%. coeficientes de correlação de Spearman, comparando os resultados obtidos por RT-qPCR e ISH, respectivamente, variou 0,084-0,325 para o valor médio a partir de cada paciente, e a partir de -0,085 a 0,515 na secção, incluindo a parte mais profunda do tumor.

Conclusão

heterogeneidade intratumoral pode influenciar a medição de expressão miRNA e, consequentemente, o número de amostras necessárias para as estimativas representativas. Nossas descobertas com dois métodos diferentes sugerem que uma amostra é suficiente para a avaliação adequada do miRNA-21 e miRNA-31, ao passo que mais amostras iria melhorar a avaliação do miRNA-125b, miRNA-145 e miRNA-630. Curiosamente, encontramos uma fraca correlação entre as estimativas de expressão obtidos por RT-qPCR e ISH, respectivamente

Citation:. Eriksen AHM, Andersen RF, Nielsen BS, Sørensen FB, Appelt AL, Jakobsen A, et al. (2016) intratumoral Heterogeneidade de MicroRNA Expressão em cancro retal. PLoS ONE 11 (6): e0156919. doi: 10.1371 /journal.pone.0156919

editor: Rajvir Dahiya, UCSF /VA Medical Center, United States