PLOS ONE: Identificação e Caracterização de CDH1 da linhagem germinativa Variantes em esporádica gástricas pacientes com câncer e em indivíduos em risco de câncer gástrico

Abstract

Objectivo

À tela e caracterizar as variantes da linha germinativa para E-caderina

(CDH1)

em pacientes com câncer gástrico não-hereditária (GC) e em indivíduos em risco de GC.

Métodos

59 GCs, 59 parentes de primeiro grau (FDRs) de GC, 20 auto-imunes metaplásico gastrite atrófica (AMAGS) e 52 doadores de sangue (BDS) foram analisadas para

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por sequenciação directa, modelagem estrutural e bioinformática. impacto funcional no splicing foi avaliada a presença de mutações intrônicas. Foram realizados E-caderina /coloração imuno-histoquímica β-catenina e E-caderina quantificação de ARNm utilizando RT-PCR

Resultados

Em GCs, 4 variantes missense (p.G274S;. p.A298T; p.T470I; p.A592T), uma mutação na 5 ‘UTR (-71C G) e uma mutação no IVS12 intrónica (c.1937-13T C) região foram encontrados. Primeiro efeito patogênico da mutação p.A298T foi previsto por modelagem proteína 3D. A nova mutação p.G274S mostrou nenhum significado funcional clara. Além disso, em primeiro lugar, IVS12 intrónica (c.1937-13T C) mutação foi demonstrado para levar a uma aberrante

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transcrição com exão 11 eliminação. Esta mutação foi encontrada em 2 GCs e 1 BD. Em FDRs, foram identificados 4 variantes: a polimórfica (p.A592T) e 3 mutações em regiões não traduzidas com papel funcional não identificado, excepto para a UTR 5 ‘(-54G C), que tinha sido encontrado para diminuir

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transcrição. Em AMAGS, detectamos 2 alterações: 1 missense (p.A592T) e 1 nova variante (mutação IVS1 (C.48 + 7C T)) sem efeito no

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splicing. Várias substituições silenciosas e polimórficos foram encontrados em todos os grupos estudados.

Conclusões

No geral nosso estudo melhora a caracterização atual de

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mutações e seu papel funcional no GC e em indivíduos em risco de GC. Mutações encontradas em regiões não traduzidas e dados sobre os efeitos de emenda merece uma atenção particular, como associado com uma quantidade de E-caderina reduzida. O utilitário de

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rastreio, para além da identificação de outros factores de risco, podem ser úteis para a detecção precoce de GC em indivíduos em risco (isto é, FDRs e AMAGS), e garante um estudo mais aprofundado.

Citation: Garziera M, Canzonieri V, Cannizzaro R, S Geremia, Caggiari L, De Zorzi M, et al. (2013) Identificação e Caracterização de

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da linhagem germinativa Variantes em esporádicos pacientes com câncer gástrico e em indivíduos em risco de câncer gástrico. PLoS ONE 8 (10): e77035. doi: 10.1371 /journal.pone.0077035

editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Estados Unidos da América

Recebido: 29 Abril, 2013; Aceito: 05 de setembro de 2013; Publicação: 29 de outubro de 2013

Direitos de autor: © 2013 Garziera et al. Este é um artigo de acesso aberto distribuído sob os termos da Licença Creative Commons Attribution, que permite uso irrestrito, distribuição e reprodução em qualquer meio, desde que o autor original ea fonte sejam creditados

Financiamento:. Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC De Re N. 10266 e AIRC Cannizzaro Programa especial Molecular Oncologia Clínica 5×1000 N. 12214) e Direzione Centrale del Lavoro, Formazione, Università e Ricerca Della Regione Autonoma Friuli Venezia Giulia, Codice Progetto 200502027001. Os financiadores não teve nenhum papel no desenho do estudo, recolha e análise de dados, decisão de publicar ou preparação do manuscrito

CONFLITO dE iNTERESSES:. Dr. Valli de Re declara que ele é um co-autor e membro do Conselho Editorial da PLOS UM. Isto não altera a adesão dos autores para todas as políticas de PLoS One sobre os dados e materiais de compartilhamento.

Introdução

O câncer gástrico (GC) continua a ser a quarta neoplasia maligna mais comum em todo o mundo, embora sua incidência e as taxas de mortalidade associadas diminuíram nas últimas décadas. prognóstico GC está intimamente relacionado com o estádio da doença no diagnóstico [1]. câncer gástrico início precoce (EOGC) é definida como GC apresentando com a idade de 45 ou mais jovens [2] e tem uma sobrevida global pobres [3], [4]. A maioria dos GCs são esporádicos e muitas vezes desenvolvem seguinte

Helicobacter pylori

(HP) -associated gastrite [5], [6]. No entanto, estudos de agregação familiar também salientar a importância de uma predisposição genética no desenvolvimento esporádico de GC. Frequência de agregação gástrico familial é de cerca de 10%

O GC classificação histopatológica mais amplamente aceite (classificação de Lauren) [7] distingue dois tipos de GC:. Tipo intestinal e tipo difuso. Difuso de GC apresenta uma maior base hereditária e geralmente um prognóstico pior em comparação com o subtipo intestinal [8].

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gene que codifica para a E-caderina foi identificada a ter um papel causal em cerca de 30% -50% dos difuso hereditário GC (HDGC), uma síndrome de GC e susceptibilidade cancro da mama lobular autossômica dominante constitui 1-3% do agrupamento familiar de GCs [9], [10] e no subtipo GC difusa [11] .

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mutações da linha germinativa (tal mutação é passado em todas as células no corpo do descendentes) são especificamente associadas com HDGC (cerca de 30% -40% de casos); grande

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eliminações foram encontrados em cerca de 6,5% dos casos [12]. Câncer familiar intestinal gástrica (FIGC), com uma história familiar positiva também têm sido descritos, mas até agora, nenhuma linha germinal

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defeitos têm sido associados com FIGC ou GCs intestinais. Esta falta de provas de

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mutações no subtipo intestinal levou à hipótese de que o agrupamento familiar, nestes casos, é determinada por factores ambientais comuns, como oposto a uma predisposição genética herdada. No entanto, dados recentes demonstram que

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alterações somáticas (tais alterações se acumulam nas células cancerosas do corpo ao longo do tempo de vida de uma pessoa) são tão freqüentes na intestinal como no GC difusa [13], o que sugere um importante papel da

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em ambos os histotipos. No entanto, a prevalência exata da

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alterações germinativas em GCs intestinal ainda é desconhecida.

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hipermetilação do promotor é o segundo hit genética mais comum no processo cancerígeno GC [14], [15].

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mutações também estão associadas com um aumento da susceptibilidade para invasivo e metastático [16], [17] do cólon, da bexiga, da próstata, da mama e os cancros ginecológicos [18] – [20]. E-caderina é uma glicoproteína transmembranar que desempenha um papel na manutenção da arquitectura do tecido epitelial, envolvendo Ca

2+ interacções célula-célula dependente [21], [22]. E-caderina compreende um domínio citoplasmático, um domínio transmembranar curto e cinco domínios extracelulares de repetição de caderina-like (EC1-5) que abrangem exões 4-13 e contêm regiões de ligação de cálcio altamente conservadas [23], [24] e conservadas cisteínas prováveis para formar pontes dissulfeto [25]

neste estudo, foram analisados ​​

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mutações germinativas em uma série de casos e indivíduos em risco de GC consecutivos GC aleatória.; principalmente de primeiro grau GC-parentes (FDRs) e pacientes auto-imunes metaplásicas gastrite atrófica (AMAG) dirigidos para o nosso instituto de sintomas gastrointestinais e avaliação endoscópica. Para explorar o papel da expressão de E-caderina, análises estruturais, funcionais e de imunohistoquímica foram realizadas em amostras com um

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mutação germinativa. O objetivo do presente estudo foi avaliar a prevalência e caracterizar

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mutações germinativas em uma série de pacientes CG esporádicos consecutivos faltam os critérios de classificação HDGC, e em uma população selecionada em risco de desenvolvimento de GC, para testar a sua utilidade como um marcador de tumor para melhorar a detecção precoce. Os dados obtidos podem ser usados ​​para desenvolver uma ferramenta que rapidamente e barata detecta

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mutações presentes principalmente em nossa população.

Resultados

caracterização dos doentes e

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germinal rastreio genético

as características clínicas e histopatológicas de assuntos GC, FDR e AMAG estão resumidas nas Tabelas 1 e 2. Entre os 59 pacientes do GC, 2 (3,4%) têm uma história familiar de GC (S15 é a irmão de S16) sem cumprir os critérios para a GC difuso hereditário, como definido pela International Câncer gástrico Linkage Consortium (IGCLC) no momento da coleta da amostra. Em nossa série GC, 5 pacientes no início da CG esporádicos (≤45 anos) estavam presentes, mas nenhum

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foram encontradas alterações nestes doentes. A idade mediana dos FDRs foi de 49 anos (variação, 28-78 anos) e para AMAGS 56 anos (variação, 31-72 anos). Entre os 59 pacientes do GC, 16 indivíduos tinham um parente de primeiro grau incluídos no estudo (16/59 FDRs). FDRs e AMAGS veio para nossa instituição para uma visita de gastroenterologia e exame de endoscopia digestiva, que se manifesta vários sintomas, mas nem câncer nem intestinal metaplasia /displasia estava presente nestes indivíduos.

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rastreio resultados genéticos são listadas na Tabela 3 com

novos

mutações: 1 intrônica (ID 5), 1 missense (ID 10) e 2 silenciosa (ID 13 e ID18). No geral, achamos 4 variantes, que código para um aminoácido (AA) de substituição (1 novel (ID10) e 3 anteriormente relatados em outras populações (ID 11, ID 12, ID 15), 1 em cada região do gene 5’near e 2 mutações no não traduzida (UTR) elemento regulador (ID 1, ID 3, já relatado) e 6 substituições em regiões intrônicas (três mutações: ID 5, ID 9, ID 17, três variantes polimórficas intr�icas: ID 4, ID 6, ID 8, provavelmente, com nenhum efeito sobre cancerogenesis GC). Sem deleções ou inserções foram encontrados nas fronteiras exão.

Outras alterações resultou polimorfismos comuns (frequência de pelo menos 1% da população) ou mutações silenciosas que codificam o mesmo aminoácido do que a cadeia original. observou Nenhum associação estatística entre os quatro grupos de pacientes testados para ID 4, ID 6 ou ID 19 variantes.

RefSNP (rs) números para identificar variantes genéticas publicado anteriormente, bem como as suas frequências indicadas (NIEHS Projeto Genoma Ambiental, Seattle, WA (URL: https://evs.gs.washington.edu/niehsExome/acessado em agosto de 2013); ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/phase1/analysis_results/paper/Acessado Dezembro de 2012) são apresentados na Tabela 3.

Todos os

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variantes foram no estado heterozigoto, exceto para o ID 4 e ID 19 no qual também foi detectado um estado homozigoto.

frequência de mutações e variantes foram calculados em indivíduos sem GC ou doença AMAG (52BDs + 59FDRs, n = 111). FDRs dezesseis eram parentes de primeiro grau de nossa série GC; quando um de a variante estava presente em GC e seu caso FDR relacionada, excluímos o indivíduo FDR do cálculo de frequência. ID4 por exemplo, estava presente em 5 FDRs relacionados com a nossa GC da nossa série; portanto, a frequência população de controle mudou de total de 111 a 106 indivíduos (7FDRs + 8BDs /106; 14,5%). A figura 1 ilustra cromatogramas sequenciamento do novas mutações que temos encontrado. Temos relatado anteriormente o cromatograma ID 10 em outro artigo [26]

(A) ID 5, nova mutação intrônica perto de exão 1 (mutação IVS1 C.48 + 7C T). Encontrado em um paciente afetado pela AMAG (S121). (B) ID 13, mutação silenciosa (c.1416C T) com resíduo conservado Ala na posição 472 em

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exão 10 (p.T472T) encontrado em um GC (S4). (C) ID 18, a mutação silenciosa (c.2073C T) com o resíduo Ala conservada na posição 691 em

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exão 13 (p.A691A) encontrado em um GC (S48)

Bioinformatic papel preditivo e modelagem estrutural resultados de variantes missense encontradas

os missense mutação resíduos que encontramos estão todos localizados ao domínio extracelular da caderina-e. A posição do codão no imatura e madura (após a clivagem N-terminal) e proteínas de dados do PolyPhen-2 e peneirar

in silico

análises são apresentados na Tabela 4. Todos os quatro variantes missense são potencialmente prejudiciais por PolyPhen -2, mas apenas o p.A298T (ID 11) e p.A592T (ID 15) substituições podem afectar a função da proteína por análise de SIFT (Tabela 4). Os p.G274S (ID 10) que, recentemente descritos [26], no entanto, não perturbar o ambiente local, mas introduz um resíduo potencial de fosforilação e glicosilação que pode ter possíveis efeitos sobre a estabilidade ea integridade da caderina-E como nós hipótese [26]. O efeito patogênico de ID 11 substituição foi estabelecido anteriormente [27], mas foi aqui primeiro demonstrada por análise estrutural. Tal como ilustrado na Figura 2A, a alteração no exão 7 AA da p.A298T (ID 11) é posicionado perto da região interactiva entre prot�meros EC1 e EC2. Assim, a substituição de resíduo polar alanina-treonina pode conduzir a formação de ligação-H através do seu grupo oxydrilic e este pode interferir com a estrutura local da proteína numa região que é fundamental para o Ca

2+ interacções. Treonina na posição 144 é estericamente demonstrado intrusivos porque interage com dois resíduos de ácido aspártico (Asp136 e Asp 138) que estão diretamente envolvidos na Ca

2 + vinculativo. Além disso, os comprimentos de ligação são particularmente estressado, sendo menos de 3 Å (Figura 2B)

A-B PyMOL e Coot softwares representações de prot�meros EC1-EC2 com base na sequência humana. (PDB código: 2O72); no C-F, EC3 e EC4 prot�meros com base em murino E-caderina (código PDB: 3Q2W) pelo software Coot. (A) destaques de representação dos desenhos animados A144 (

amarelo

) Posição: A144 está próximo aos locais de cálcio (

roxo

) e na proximidade da interface de dimerização entre EC1 (

azul e ) -EC2 (

verde

) domínios. (B) a representação estrutural de substituição A144T no domínio EC2. Posição do AT144 spotlighted em amarelo. Treonina na posição 144 é bastante dramático para estrutura local porque interage com dois resíduos de ácido aspártico (

verde

) diretamente envolvidos nos locais de cálcio, e estes comprimentos de ligação são particularmente estressado sendo menos de 3 Å. (C) A T316 (

amarelo) é

O

-glycosilated (

azul e) e presente na superfície do domínio EC3. (D) A cadeia de lateral hidrofóbica de I316 (

amarelo

) não pode ser

O

-glycosilated e promove interações proteína-proteína. (E) A cadeia lateral metilénico de A438 (

amarelo) permite a liberdade conformacional na superfície do domínio CE4. (F) T438 (

amarelo

) a substituição não é dramática para a estrutura local, mas poderia representar um local potencial para modificações pós-traducionais. íons de cálcio são destacadas (

verde).

No que diz respeito às restantes duas mutações missense, eles têm um efeito menos claro funcional como também apresentados na Tabela 4. p .T470I (ID 12) substituição de [28] torna a superfície de AA EC3 extradomain na proteína madura (Figura 2C). Em ambos os murina E-caderina e N-caderina de sequência (código PDB: 3Q2W) treonina é normalmente encontrado

O

-glycosylated sugerindo um papel importante para este resíduo na estrutura da proteína. No entanto, como mostrado na Figura 2D, a mudança de isoleucina, uma AA não-polar, com uma cadeia lateral hidrofóbica que não pode sofrer modificação pós-translacional, sugere que não há tensão intermolecular particular. Nós supomos que, no meio extracelular, a presença de um resíduo de isoleucina na mesma posição do que a treonina podem favorecer as interacções proteína-proteína, e esta mutação pode, assim, assumir um significado de protecção. A última mutação relatado, p.A592T (ID 15), foi encontrado em todos os grupos testados (ver Tabela 3), o que sugere um efeito sobre a patogénese improvável GC. Neste caso, alanina na EC4 extradomain do maduro E-caderina (Figura 2E) oferece liberdade conformacional, mesmo quando em proximidade dos Ca

2 + sítios de ligação. Uma substituição de treonina aqui tem um efeito limitado sobre a estrutura e torção ângulos locais da proteína. No entanto, não podemos excluir que a cadeia lateral, oxydrilic poderia ser modificado pós-tradução em particular situação e, assim, influenciar a estrutura e função do

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(Figura 2F).

análise Transcrição mutações germinativas intr�icas

Para explorar se as mutações intrônicas detectadas em nossa série GC (Tabela 3) pode potencialmente induzir um efeito sobre a emenda, foi realizada

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análise da transcrição. variantes polimórficas e silenciosos foram excluídos dessa análise, uma vez que eles provavelmente não têm nenhum papel patogênico. ADNc produzido a partir de sangue periférico de indivíduos GC seleccionados albergando ID intrónico 5, 9 de ID ou ID 17 mutações (Tabela 3) foram comparados com os que a partir de dois dadores de sangue saudáveis, uma única que tem o mesmo ID de 17 mutação como pacientes GC (código BD S190 ), e outra (código BD S189) sem

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mutação.

para os ID 5 e ID 7 mutações intrônicas, que amplificou a região que abrange parte do exão 1 a parte do exão 5, para mutação ID 17, exão 10 a 13 (Figura 3). A RT-PCR o exão 1 a 5 fragmentos não mostraram diferenças quando executado em 4% de gel de agarose (Figura 3A), nem após sequenciação bidireccional (dados não mostrados); por converse ID 17 variante intrônica poderia afetar splicing levando a uma menor

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transcrição anormal (Figura 3B). Após o isolamento e a sequenciação, verificou-se que a banda mais pequena resultou num transcrito ignorado falta o exão 11, 10 com o exão directamente juntou-se ao exão 12. Esta transcrição aberrante também foi detectado no BD S190 transportando a mesma substituição de linha germinal (Figura 3B).

ARNm total foi extraído a partir de PBMC de cada amostra representada e retrotrascribed em ADNc de cadeia simples para amplificar: (a) Os exões 1-5 de cerca de 768 pb. No paciente segunda pista AMAG (S121) portador da mutação ID 5 (mutação IVS1 C.48 + 7C T); na terceira faixa FDR (S97) que transporta a mutação 9 de ID (IVS4 c.532-18C t); (B) Os exons 10-13 de cerca de 686 pb. GC (S10), GC (S46) e BD (S190) portador da mutação ID 17 (IVS12 c.1937-13T C). Setas amarelas evidenciar uma banda menor correspondendo a transcritos aberrantes sem o exon 11; (C) β-actina foi utilizada como controlo interno de amplificação. MW: uma escada de DNA Kb. Os produtos de PCR foram executados em um de agarose a 4% e gel corado com SYBR Green dyef

Análise do

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nível de abundância de proteínas e expressão de mRNA em indivíduos mostrando

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mutações intrónicas

Uma comparação do nível de expressão de ARNm da e-caderina foi realizada a partir de linfócitos EBV imortalizadas obtidas a partir do sangue periférico de S10 e S190 (ID mutação 17), S97 (ID 9) e S189 (sem

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mutações) assuntos. Assunto S10 foi afetado por um câncer gástrico, sujeita S97 é parente de primeiro grau de um paciente com um câncer gástrico (FDR), enquanto S189 e S190 foram ambos doadores de sangue. Observou-se entre o doador de sangue de controlo (S189) não tendo nenhuma

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mutação e os pacientes, uma forte diminuição relativa na expressão da caderina-E (cerca de 60%, a Figura 4) em paciente S10 tendo ambos ID 17 mutação e uma GC, enquanto a redução de apenas cerca de 2% no doador de sangue S190 tendo a mesma mutação ID 17 (

P

0,05, em relação a GC S10). Para S97 (ID mutação 9, FDR assunto), observou-se uma expressão de E-caderina semelhante ao que no controle S189.

A quantificação relativa dos níveis de E caderina-mRNA em linfócitos EBV imortalizado (LCL). LCLS foram gerados a partir da sementeira de 2,5 × 10

6 PBMC imortalizadas por EBV B.95.8 e cultivadas em suspensão. Cerca de 8 milhões de células foram colhidas para cada amostra após a imortalização. Os pacientes testados foram: GC S10 abrigar a variante ID 17 (IVS12 c.1937-13T C), FDR S97 carregando o ID 9 (IVS4 c.532-18C T), BD S190 com ID 17 e BD S189 sem qualquer

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mutação. S189 foi considerada como a referência (valor de 1) Os resultados são representativos de três experiências independentes. nível de expressão de E-caderina foi normalizada normalizados de dados para p-actina estão representados como médias ± DP. *, P 0,05, **, p . 0,01

A análise imunohistoquímica no tecido gástrico tumor de intrônica ID 17 caso (código paciente S10, Figura 5E) mostrou uma redução da expressão de membrana-bound e-caderina nas células tumorais em anel de sinete (setas pretas), enquanto que tanto membrana e coloração citoplasmática estavam presentes no epitélio normal. O mesmo paciente mostrou reduzida coloração β-catenina em células em anel de sinete, em comparação com a forte expressão desta proteína nas células adjacentes normais (Figura 5H). A perda de tanto de E-caderina e β-catenina coloração também foi notada para as segundas pacientes (S46) que tem a mesma intrónica ID 17 mutação e afectada por GC também (Figura 5F e 5I, respectivamente para a E-caderina e β-catenina) .

(a) hematoxilina e eosina no tecido gástrico normal. (B) de Hematoxilina-eosina no tecido tumoral de GC S10 com carcinoma de células anel de sinete: células em anel de sinete são realçados por setas pretas. (C) hematoxilina e eosina provas do histotipo difusa de GC S46. (D) a coloração de E-caderina em tecido gástrico normal. (E) Redução de coloração de E-caderina nas células em anel de sinete de GC S10 relação a células normais adjacentes; células em anel de sinete são realçados por setas pretas. (F) perda da expressão de E-caderina nas células tumorais difusas de GC S46 em comparação com o tecido normal (no lado direito da f otomicrograf ia). (L) coloração β-catenina em tecido gástrico normal. (H) Fracamente coloração β-catenina em células em anel de sinete (setas pretas) de GC S10. (I) a perda de coloração β-catenina no tecido tumoral de GC S46 em comparação com o tecido normal (no lado direito da f otomicrograf ia). Todas as fotomicrografias foram feitas em 400 × ampliação.

Discussão

pacientes GC normalmente têm um prognóstico pobre [29]. Identificação de pacientes com um risco aumentado de desenvolvimento de GC e a detecção precoce do GC são abordagens promissoras para reduzir a morbidade e mortalidade da GC. FDR dos pacientes do GC são conhecidos por terem um risco 2-3 vezes maior de GC, provavelmente devido à exposição aos mesmos fatores de risco ambiental e /ou a susceptibilidade hereditária ao câncer [30].

A destruição de células parietais encontrado em AMAG combinado com o importante papel da e-caderina em polaridade epitelial e arquitetura glandular gástrica, sugere que as alterações da linha germinativa de

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poderia ser um fator de risco adicional para o desenvolvimento GC na AMAG paciente [31].

Em 1998, Guilford e colegas descreveram para as primeiras mutações germinativas tempo do

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[28]. Subsequentemente, diferentes tipos de mutações têm sido relatados em famílias de diferentes etnias com GC difusa [32], [33]. A primeira

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mutação germinativa foi descrita em uma família italiana em 2006, em um paciente que preencheram os critérios de IGCLC para HDGC [34]. No entanto, poucos estudos relatam

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mutações germinativas em casos esporádicos GC sem agregação familiar ou em indivíduos em risco de desenvolver GC [35], [36]. Além disso, nestes estudos os efeitos funcionais do

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variantes muitas vezes não são investigados.

A força do nosso estudo é a coleção de 59 pacientes caucasianos com CG esporádicos, 59 FDRs e 20 AMAGS que participaram do nosso serviço de gastroenterologia nos últimos anos para sintomas gástricos e um diagnóstico ou exclusão de um GC após endoscópica e avaliação tecido histológico.

Como resumido na Tabela 3, vários germinativas diferente

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variantes têm foi detectado. Na série de 59 GC, excluindo as mudanças polimórficas e silenciosas que provavelmente não tem nenhum papel patogênico, encontramos 6 substituições diferentes em 9 pacientes (9/59 GCs = 15,2%): 4 do tipo missense (ID 10, ID 11, ID 12, ID 15) em 4 pacientes distintos (6,8%) e 2 do tipo não-missense (ID 2 e ID 17) em 5 GCs distintos (3,4%).

O ID 10 (p.G274S) é uma nova mutação missense que encontramos em um homem velho com uma histotipo mista GC. Esta variante não foi detectada em 187 indivíduos sem câncer (108BDs + 59FDRs + 20AMAGs), excluindo, assim, um polimorfismo. Um efeito patogênico da ID 10 mutação não foi apoiado após funcional (agregação e invasão)

in vitro

ensaios como nos informou recentemente [26], não obstante os dados do

in silico

caracterização da mutação e uma redução na expressão β-catenina encontradas no tecido do tumor não pode excluir completamente o significado desta mutação no desenvolvimento de GC. Assim, no hoje ID 10 permanece um romance

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mutação com uma patogênese de um significado indeterminado.

O ID 11 (p.A298T) a substituição no exão 7 de

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já foi descrito em um homem caucasiano jovem de 36 anos de idade, em uma família HDGC [27]. Em nossa série, esta variante foi detectada apenas em 1 masculino (S47) de 74-year-old com um histotipo mista. O efeito potencial patogênico desta mutação foi confirmada através de

in vitro

estudos funcionais em laboratórios diferentes [27], [37], [38]. Aqui primeiros resultados de modelos (Figura 2A-B) através da análise de proteínas de ligação ao ligando 3D, apoiam fortemente o potencial para a função da proteína alterada e levar ao possível mecanismo molecular que sustentam este processo. A função da proteína alterada potencial foi apoiada também da análise SIFT (Tabela 4) com uma boa pontuação. Além disso, um estudo recente, utilizando o

in silico

projeto proteína FoldX abordagem algorítmica [39], reafirma o papel patogênico do 11 (p.A298T) a substituição ID, com base em um cálculo das alterações de estabilidade no estado nativo (ΔΔG 0,08 kcal /mol) [40]. Autores caracterizado pacientes portadores desta mutação missense como tendo uma idade mais jovem no momento do diagnóstico e uma histotipo difusa. Nosso caso destacou que ID 11 também pode ser detectado em um paciente idoso com GC mista.

O ID 12 (p.T470I) foi encontrado em um homem de 57 anos de idade (S39) com diagnóstico de GC . Esta mudança foi descrita pela primeira vez em uma família de etnia maori com EOGC, mas o assunto mostrando esta mutação não foi afetada pela GC no momento do estudo [28]. Aqui, verificou-se que a mudança p.T470I AA é tolerado pelo SIFT e também por análise de modelação. Infelizmente, o tumor espécime de tecido bioptic era insuficiente para executar a E-caderina IHC coloração.

O ID 15 substituição (p.A592T) foi detectada em cada grupo clínico testados, sugerindo uma difusão polimórfica provável. No entanto, esta variante foi relatada anteriormente associado com tumores de tireóide e câncer de mama lobular [41] – [43]. Nossa análise estrutural e

in vitro

[35] e

in silico

estudos [38], [40] não suportam um papel patogênico para esta variante no GC.

Conforme recomendado pelo orientações de gestão clínica recentes [44], a vigilância endoscopia deve ser realizada anualmente em indivíduos com mutações de significado indeterminado (por exemplo, missense). Em nossa opinião, os indivíduos portadores ID 15 e também ID 10, devem ser acompanhados por até 10 anos antes de se excluir um papel embora fraca para esta alteração na patogênese da GC.

No ID 2 foi identificado um C mudança -para-G antes do códon de iniciação (-71C G,

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5’UTR região), que representava a variante mais comum associado ao GC em nossa série, ocorrendo em três dos 59 pacientes do GC ( 5,1%). Esta variante também foi relatado em um estudo finlandês [45] em 1 de 13 (7,7%) pacientes do GC e, em 2 de 51 controles (3,9%), e também em dois pacientes EOGC de origem americana do Norte (3,4%) [46] . Os dados gerais destes estudos sugerem que ID 2 é uma mutação muito comum, mas os autores não relataram dados sobre variante ID 2 em relação ao estado de expressão da caderina-E. ID 2 foi encontrada em nossa série em um intestinal, uma mista e uma histotipos GC difusas. Todos estes pacientes tinham mais de 50 anos no momento do diagnóstico e foram negativos para infecção pelo HP. Nenhum dos indivíduos do grupo controle (n = 111) testadas, sem GC, mostrou esta mutação (Tabela 3). Um

in situ

avaliação ou uma correlação entre ID 2 e expressão da caderina-E foi incapaz de ser realizada devido à falta de material de tumor. O efeito potencial patogênico dessa variante promotor em nível de expressão da caderina-E merece mais estudos

Intronic variantes ID 17 (IVS12 c.1937-13T C). Foi encontrado em 2 fêmeas com GC (2/59 GCs = 3,4%) tanto positiva para a infecção por HP, e verificou-se também em um BD (1/52 = 1,9%, Quadro 3). A mesma alteração foi previamente relatado no cancro da mama lobular com alta frequência (12/53 = 23%) [47], nas famílias hdgc (2/27 = 7,4%) [48] e em pacientes EOGC (7/79 = 8,9% ) [46], mas também numa população de controlo relativo [46]. De nota, demonstramos pela primeira vez que esta substituição conduz a uma aberrante

CDH1

transcrição abrigar uma deleção do

CDH1

exão 11. Exon 11, juntamente com sequências parciais dos exons flanqueando , codifica para o domínio EC4 da proteína madura [25]; ID 17 é uma supressão para fora de grelha e leva à formação de um codão de paragem prematuro na posio 384 do promotor CE4. Por conseguinte, a proteína traduzida a partir de

CDH1

ID 17 Strand poderia falta o domínio transmembranar e a cauda citoplasmática que está envolvido na ligação β-catenina. Ambos os pacientes GC S10 e S46, possuindo a mutação ID 17, mostrou uma redução na expressão de E-caderina e β-catenina por IHC análises (Figura 5); o paciente GC S10, com um carcinoma de células anel de sinete, foi diagnosticado com a idade de 61 anos, e o paciente GC S46, com um adenocarcinoma difusa, foi diagnosticado com a idade de 58 anos. Além disso, a avaliação da expressão de E-caderina do EBV imortalizadas B-linfócitos mostrou uma redução forte (60%) em GC S10 abrigando ID 17 mutação, em comparação com o controlo BD (S189) sem>

alterações, mas também, em comparação com um único dador de sangue (S190) transportando a mesma variante de ID 17. Uma vez que todos os indivíduos que transportam a mutação ID 17 são heterozigóticos para o gene da

CDH1

, os nossos dados indicam que o indivíduo S190, mas não de células tumorais de pacientes S10 e S46, podem explorar um mecanismo compensatório que neutraliza a E-caderina infra-regulação. Em tumores, E-caderina sob-expressão está ligada à actividade de transcrição reforçada β-catenina, um efector principal da via Wnt [49]. A expressão de um grande número de genes relacionados com a progressão do tumor, incluindo aqueles para ciclina D1, c-

myc

, factor de crescimento endotelial vascular, e survivina é controlada através da via Wnt /β-catenina [50]. ligação a p-catenina impede a sua translocação para o núcleo de E-caderina; Por conseguinte, uma redução da expressão de E-caderina pode favorecer GC patogénese através de um aumento da acumulação β-catenina nuclear. Como os pacientes S10 e S46 com variante ID17 são tanto as mulheres mostrando um helicobacter pylori infecção (HP), assumimos que ID 17 pode ser associado a um fator prognóstico sexo-específicos (é sabido que a incidência de GC é maior para homens do que para as mulheres) e /ou uma infecção HP. A deleção do exon 11 no

gene CDH1

também foi descrita em um paciente HDGC, mas neste último caso splicing aberrante foi associada a uma mutação intrônica diferente (IVS11 c.1711 + 5G A) [27] .

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