Abstract
Fundo
Cancro /antígenos testiculares (CTAs) foram descobertos como alvos imunogénicos normalmente expressos em células germinativas, mas diferencialmente expressos em uma variedade de cancros humanos. Neste estudo, foi utilizada uma abordagem de triagem epigenética integrativo para identificar genes coordenadamente expressas no câncer de pulmão de células não pequenas humano (NSCLC), cuja transcrição é conduzida por desmetilação promotor.
Metodologia /PRINCIPAIS CONCLUSÕES
a nossa abordagem de triagem encontrados 290 genes significativos dos mais de 47.000 transcrições incorporados na matriz de expressão 2,0 Affymetrix Human Genome U133 Plus. Dos 55 melhores candidatos, 10 mostraram ambos hipometilação sobre-expressão diferencial e a região do promotor em NSCLC. Surpreendentemente, 6 dos 10 genes descobertos por esta abordagem foram CTAs. Usando um grupo separado de tumor primário e de tecido normal, que validado promotor NSCLC hipometilação e aumento da expressão por RT-PCR quantitativo para todos os 10 genes. Notamos co-expressão significativa, coordenada de múltiplos genes-alvo, bem como coordenado desmetilação promotor, em um grande conjunto de tumores individuais que foi associado com o subtipo SCC do NSCLC. Além disso, foram identificados 2 novos genes alvo que apresentaram efeitos em várias linhas celulares promoção do crescimento,.
Conclusões /Significado
Coordenado desmetilação promotor em NSCLC está associada à expressão aberrante de CTAs e potencial, proto-oncogenes novos candidatos que podem ser identificados utilizando técnicas de descoberta integrativa. Estes resultados têm implicações significativas para a descoberta de novos CTAs e antígeno CT imunoterapia dirigida
Citation:. Glazer CA, Smith IM, Ochs MF, Begum S, Westra W, Chang SS, et al. (2009) Integrative Descoberta de epigenetically desreprimida Câncer Testículo Antígenos em NSCLC. PLoS ONE 4 (12): e8189. doi: 10.1371 /journal.pone.0008189
editor: Alfons Navarro, da Universidade de Barcelona, Espanha