Abstract
Introdução
O folato e um teor de carbono metabolismo estão ligados ao risco de câncer através de seu papel fundamental na síntese de DNA e metilação. Variação de genes do metabolismo de um carbono, particularmente
MTHFR
, tem sido associado com o risco de vários tipos de câncer em estudos epidemiológicos, mas pouco se sabe sobre o câncer renal.
Métodos
marca única polimorfismos de nucleotídeo (SNP) selecionada para produzir a cobertura genômica alta de 13 regiões de genes do metabolismo de um carbono (
ALDH1L1
,
BHMT
,
CBS
,
FOLR1
,
MTHFR
,
MTR
,
MTRR
,
SHMT1
,
SLC19A1
,
Tyms
) ea via de síntese de glutationa estreitamente associado (
CTH
,
GGH
,
GSS
) foram genotipados para 777 carcinoma de células renais (RCC) casos e 1.035 controles no estudo de caso-controle de Câncer renal Europa Central e Oriental. Associações de SNPs individuais (n = 163) com risco de RCC foram calculadas por meio de regressão logística não condicional ajustado para idade, sexo e centro de estudos. permutação mínimo valor-p testes (Min-P) foram utilizados para identificar regiões de genes associados com o risco, e haplótipos foram avaliados dentro destes genes.
Resultados
Foram observadas as associações mais fortes com risco RCC para
SLC19A1
(P
min-P = 0,03) e
MTHFR
(P
min-P = 0,13). Um haplótipo que consiste em quatro SNPs em
SLC19A1
(rs12483553, rs2838950, rs2838951, e rs17004785) foi associado com um risco aumentado de 37% (p = 0,02) e análise estratificada exploratória sugeriu a associação foi significativa apenas entre aqueles no mais baixo tercil de consumo de vegetais.
Conclusões
para o nosso conhecimento, este é o primeiro estudo a examinar exaustivamente variação de genes do metabolismo de um carbono em relação ao risco de RCC. Nós identificamos uma associação romance com
SLC19A1
, que é importante para o transporte de folato nas células. Replicação em outras populações é necessário para confirmar estes resultados
Citation:. Gibson TM, Brennan P, Han S, Karami S, Zaridze D, Janout V, et al. (2011) Avaliação abrangente de um carbono do metabolismo Caminho variantes genéticas e risco de câncer de células renais. PLoS ONE 6 (10): e26165. doi: 10.1371 /journal.pone.0026165
editor: Daniel Monleon, Instituto de Investigación Sanitaria INCLIVA, Espanha